
Science:何跃辉团队揭示全新组蛋白去甲基化酶KGDH活性的调控 …
2023年7月15日 · 该研究报道了三羧酸循环(TCA Cycle)的限速酶 α-酮戊二酸脱氢酶复合体 (α-ketoglutarate dehydrogenase,KGDH)响应光信号进入细胞核,并与JMJs蛋白互作;KGDH通过竞争性代谢α-酮戊二酸,抑制了JMJs的组蛋白去甲基化活性,从而在全基因组水平调控组蛋白的甲基化修饰进而调控一系列环境响应基因表达的分子机制。 原核和真核生物的α-酮戊二酸脱氢酶复合体是线粒体呼吸作用-三羧酸循环过程中的限速酶,起着将α-酮戊二酸氧化脱羧转变为琥珀酰 …
发现:通过KGDH控制组蛋白去甲基化 - 知乎 - 知乎专栏
研究人员构建了几个α-酮戊二酸脱氢酶 (KGDH)功能缺失的拟南芥突变体,发现KGDH不仅在控制细胞内的 α-KG 总量、TCA循环通量和细胞呼吸中起主要作用,而且还调节生长发育的各个方面。 KGDH缺陷的突变体表现出强效抗氧化剂花青素的积累,向开花的发育过渡的显著延迟,以及梢发育的减缓。 接下来,通过共聚焦荧光成像,发现一小部分KGDH进入细胞核。 这一过程受光照调节。 随后诱变了KGDH亚基E2的核定位信号,发现线粒体定位的KGDH不能挽救E2突变体中的 …
三羧酸循环的过程与酶(二) - 知乎专栏
三羧酸循环 的第四步是 α-酮戊二酸氧化脱羧,生成琥珀酰辅酶A,由 α-酮戊二酸脱氢酶复合体 (alpha-ketoglutarate dehydrogenase complex,A-KGDH或2-oxoglutarate dehydrogenase complex,OGDC)催化。 这是第二次氧化脱羧,生成NADH。 KGDH与PDH同属于一个家族(2-氧代酸脱氢酶复合体家族),所以催化机制与PDH很相似,E1为α-酮戊二酸脱氢酶,E2为二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶,E3为二氢硫辛酰胺脱氢酶。 KGDH不仅调控三羧酸循环的流量,而且与 …
α-酮戊二酸脱氢酶(KGDH):植物能量代谢和基因表达之间的新 …
先前的研究已经证实,α-KG的细胞水平主要由α-酮戊二酸脱氢酶(KGDH)决定,该酶由三个亚基组成:氧戊二酸脱氢酶(OGDH,E1)、二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶(DLST,E2)和二氢硫辛酰胺脱氢酶(DLD,E3; Millar 等人,1999)。 为了研究 KGDH 的代谢和生物学功能,作者首先在模式植物拟南芥 中鉴定或构建了 OGDH 和 E2 亚基的功能丧失突变体。 遗传分析表明,OGDH 或 E2 功能的缺失导致开花延迟,在双突变体 ogdh1 ogdh2 中尤其明显。 此外,OGDH功能的破 …
Science | 北京大学何跃辉团队揭示核定位的α-酮戊二酸脱氢酶复合 …
何跃辉团队通过正向或反向遗传学方法获得了 拟南芥 KGDH两个亚基E1(oxoglutarate dehydrogenase, OGDH1和OGDH2)和E2(dihydrolipoamide succinyltransferase, E2a …
Science | 何跃辉团队揭示核定位的α-酮戊二酸脱氢酶复合体调控组 …
2023年7月23日 · 何跃辉团队通过正向或反向遗传学方法获得了拟南芥KGDH两个亚基E1(oxoglutarate dehydrogenase, OGDH1和OGDH2)和E2(dihydrolipoamide succinyltransferase, E2a和E2b)的功能缺失突变体。 研究结果表明,这些突变体尤其是E1的双突变体表现出明显的延迟开花和花青素积累的表型,并且影响了TCA循环的中间代谢物的水平,呼吸作用受到了抑制。 尽管α-KG作为JMJs的辅助底物能够通过影响JMJs的酶活性进而调控基因 …
α酮戊二酸脱氢酶(α-KGDH)活性检测试剂盒 微量法
α-KGDH(EC 1.2.4.2)广泛存在于动物、植物微生物和培养细胞的线粒体中,是三羧酸循环调控关键酶之一,催化α-酮戊二酸氧化脱羧生成琥珀酰辅酶 A。 α-KGDH 催化α-酮戊二酸、NAD+ 和辅酶 A 生成琥珀酰辅酶 A、二氧化碳和 NADH,NADH 在340 nm 有特征吸收峰,以 NADH 的生成速率表示α-KGDH 活性。 试验中所需的仪器和试剂:紫外分光光度计/酶标仪、水浴锅、台式离心机、可调式移液器、微量石英比色皿/96 孔板(UV板)、研钵/匀浆器、冰和蒸馏水。
研究揭示核定位α-酮戊二酸脱氢酶对组蛋白去甲基化的控制
2023年7月14日 · We found that the tricarboxylic acid cycle–associated enzyme α-ketoglutarate (α-KG) dehydrogenase (KGDH) entered the nucleus, where it interacted with various JMJs to regulate α-KG–dependent histone demethylations by JMJs, and thus controlled genome-wide gene expression in plants.
KAT2A 与 α-KGDH 复合物作为组蛋白 H3 琥珀酰转移酶,Nature - X …
2017年12月1日 · 在这里,我们展示了 α-酮戊二酸脱氢酶 (α-KGDH) 复合物位于人类细胞系的细胞核中,并与基因启动子区域的赖氨酸乙酰转移酶 2A(KAT2A,也称为 GCN5)结合。 我们表明琥珀酰辅酶 A(琥珀酰辅酶 A)与 KAT2A 结合。 KAT2A 催化结构域与琥珀酰辅酶 A 复合物在 2.3 Å 分辨率下的晶体结构表明,琥珀酰辅酶 A 与 KAT2A 的深裂口结合,琥珀酰部分指向柔性环 3 的末端,该环采用不同的结构构象以琥珀酰辅酶A结合和乙酰辅酶A结合形式。 定点诱变表明该环 …
α‐Ketoglutarate dehydrogenase (KGDH): A new balancer between …
Previous studies have established that the cellular level of α-KG is primarily determined by α-ketoglutarate dehydrogenase (KGDH), which is composed of three subunits: oxoglutarate dehydrogenase (OGDH, E1), dihydrolipoamide succinyltransferase (DLST, E2), and dihydrolipoamide dehydrogenase (DLD, E3; Millar et al., 1999).
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