
rG4-seq reveals widespread formation of G-quadruplex ... - Nature
2016年8月29日 · We introduce RNA G-quadruplex sequencing (rG4-seq), a transcriptome-wide RNA G-quadruplex (rG4) profiling method that couples rG4-mediated reverse transcriptase stalling with next-generation...
丁一倞研究组发布首个多物种转录组G四联体结构数据库
2022年10月25日 · 在所有的RNA结构中,RNA G四联体(RNA G-quadruplex, rG4)是一种重要的RNA三级结构。 它通常富含鸟嘌呤(G-rich)并同时包含Hoogsteen碱基和Watson-Crick碱基。 目前,rG4被证明在转录后调控过程发挥重要作用,包括抑制翻译过程,减弱RNA降解,影响miRNA的结合以及RNA的可变剪切等【1】。 rG4具有明显的序列特征,如典型的rG4为四组三联鸟嘌呤与三个长度不超过7nt的环 (G3N1-7)。 此外,还有一些非经典的rG4结构,如二联鸟嘌 …
RNA G-quadruplexes (rG4s): genomics and biological functions
2021年6月4日 · In this review, we will summarize the innovative high-throughput methods recently developed to detect rG4s on a transcriptome-wide scale, highlight the many novel and important functions of rG4 being discovered in vivo across the tree of life, and discuss the key biological questions to be addressed in the near future.
NAR丨郭骏杰/陈硕斌团队开发基于RNA G-四链体的新型PROTAC用于rG4 …
2025年2月7日 · RNA G-四链体 (rG4) 是广泛存在于转录组中的非典型二级核酸结构,通过与rG4结合蛋白 (G4BPs) 相互作用,在生命体基因调控过程中起着至关重要的作用,rG4-G4BP复合体已成为备受关注的药物靶点。
QUADRatlas: the RNA G-quadruplex and RG4-binding proteins …
2023年1月6日 · RNA G-quadruplexes (RG4s) are non-canonical, disease-associated post-transcriptional regulators of gene expression whose functions are driven by RNA-binding proteins (RBPs). Being able to explore transcriptome-wide RG4 formation and interaction with RBPs is thus paramount to understanding how they a …
G-Quadruplexes in RNA Biology: Recent Advances and
2021年4月1日 · RNA G-quadruplexes (RG4s) are four-stranded structures known to control gene expression mechanisms, from transcription to protein synthesis, and DNA-related processes.
OrensteinLab/rG4detector - GitHub
We present rG4detector, a convolutional neural network for predicting rG4 folding of any given sequence based on rG4-seq data. rG4-seq experimental protocol was employed to generate transcriptome-wide rG4 maps of human HeLa cells (accession code GSE77282).
Identification of G-quadruplex nucleic acid structures by high ...
2025年3月1日 · G-quadruplexes (G4s) are non-canonical nucleic acid secondary structures formed by guanine-rich DNA or RNA sequences. These structures play pivotal roles in cellular processes, including DNA replication, transcription, RNA splicing, and protein translation.
Cell | RNA G四链体促进α-synuclein累积 - 网易
2024年11月3日 · 近日,来自日本熊本大学的 Yasushi YabukiI 和 Norifumi Shioda 研究团队在 Cell 上发表题为 RNA G-quadruplexes form scaffolds that promote neuropathological a-synuclein aggregation 的文章, 发现RNA G四链体的组装为αSyn的累积提供支架,细胞内Ca2+可以诱导RNA G四链体组装,并促进αSyn相变和沉积,用药物抑制RNA G四链体组装可以抑制αSyn累积、神经退行以及相关运动缺陷。
NAR | 丁一倞研究组发布首个多物种转录组G四联体结构数据库
2022年10月25日 · 在所有的RNA结构中,RNA G四联体 (RNA G-quadruplex, rG4) 是一种重要的RNA三级结构。 它通常富含鸟嘌呤 (G-rich) 并同时包含Hoogsteen碱基和Watson-Crick碱基。 目前,rG4被证明在转录后调控过程发挥重要作用,包括抑制翻译过程,减弱RNA降解,影响miRNA的结合以及RNA的可变剪切等 【1】。 rG4具有明显的序列特征,如典型的rG4为四组三联鸟嘌呤与三个长度不超过7nt的环 (G3N1-7) 。 此外,还有一些非经典的rG4结构,如二联 …