
生信笔记:宏基因组 ARGs-OAP proto进行ARGS功能注释 - 知乎
ARGs是一种新型、持久性的环境污染物,细菌中携带ARGs的质粒、整合子以及转座子等可在同种属菌株间和不同种属的菌株间发生水平基因转移(Horizontal genetransfer,HGT),即使抗性菌株死亡后,携带ARGs的裸露 DNA会在脱氧核苷酸酶的保护作用下长期存在。
Assessment of extracellular antibiotic resistance genes (eARGs…
2019年4月1日 · ARGs exist in two forms: intracellular ARGs (iARGs) and extracellular ARGs (eARGs). iARGs present as intracellular DNA (iDNA) may promote ARB dissemination via conjugation from cell-to-cell contact, and transduction because of infection of bacterial phages, while eARGs present as extracellular DNA (eDNA), can be assimilated by the competent non ...
抗生素抗性基因(ARGs)分析方法及数据库 - 知乎 - 知乎专栏
抗生素抗性基因(args)已然成为威胁人类健康与生态环境的重大隐患,其广泛传播和潜在危害不容忽视。高通量定量 pcr 法和宏基因组学方法作为检测 args 的两大主流手段,各有优劣,为科研人员提供了不同的研究视角和技术支撑 。
Antibiotics resistance gene 抗生素抗性基因(ARG) - 简书
2023年5月24日 · card提供参考 dna 和蛋白质序列、检测模型和基于细菌抗菌素耐药性(amr)分子基础的生物信息学工具,设计了抗生素抗性本体论 (aro)。 ARO 分为三个主要分支:抗生素耐药性决定因素(ARO:3000000)、抗生素分子(ARO:1000003)和抗生素耐药机制(ARO:1000002),最新的CARD现在已经 ...
Forecasting the dissemination of antibiotic resistance genes across ...
2021年4月23日 · Antibiotic resistance spreads among bacteria through horizontal transfer of antibiotic resistance genes (ARGs). Here, we set out to determine predictive features of ARG transfer among bacterial...
海洋环境中抗生素抗性基因的分布、来源、传播和风险研究
自然转化是指来自细胞外环境的裸露dna(args)被细菌主动吸收并整合到它们的基因组中。转化过程主要依赖于细胞外dna,在海水环境中dna浓度极易被稀释,因此,自然转化在海洋环境条件下可能很难发生。目前转化过程在海洋环境中研究较少 [77] 。
环境中抗生素抗性基因(ARGs)形成和传播机制研究进展
2024年9月30日 · 摘要: 从DNA损伤和错误修复角度阐述了环境中抗生素抗性基因(Antibiotics resistance genes,ARGs)的形成机制,并对DNA损伤和错误修复过程中涉及的相关核心功能基因片段进行归纳总结.也从细胞代谢角度阐述了环境中ARGs进行水平传播的三种主要机制,包括:菌毛架桥 …
大型干货现场!抗生素抗性基因(ARGs)分析一站式方案超全解析
2020年1月22日 · ARGs是一种新型、持久性的环境污染物,细菌中携带ARGs的质粒、整合子以及转座子等可在同种属菌株间和不同种属的菌株间发生水平基因转移(Horizontal genetransfer,HGT),即使抗性菌株死亡后,携带ARGs的裸露 DNA会在脱氧核苷酸酶的保护作用下长期存在[5]。
Antibiotics resistance gene 抗生素抗性基因(ARG) - CSDN博客
2023年5月24日 · 通过深度学习方法,分别为短读序列和全基因长度序列构建了两个深度学习模型 DeepARG-SS 和 DeepARG-LS,提供了准确的抗菌素耐药性注释。 快速筛选金黄色葡萄球菌和结核分枝杆菌原始 FASTQ 测序结果中的 AMR 基因和 SNP,并对 12 种抗菌药物进行抗生素谱预测。
水环境中抗生素抗性基因的分布·转移与去除研究进展 - 知猫论文
2024年11月23日 · 当细菌生活的环境中有低浓度抗生素长期存在时,细菌会形成耐药性,成为抗生素耐药菌(antibiotic resistant bacteria,ARB),同时导致抗性基因(antibiotic resistant genes,ARGs)的出现。 目前在医院 [6]、饲养场 [7]、药厂 [8]和污水处理厂 [9]等排放的废液中均检测到ARGs的存在。 有研究表明 [10],ARGs可以通过Ⅰ型整合子等可移动基因元件的作用进行转移,对环境造成污染。 因此,研究ARGs在水环境中的分布情况、转移方式及不同去除工艺 …