Therefore, double-label confocal microscopy with markers specific to plaques (β-amyloid), NFTs (AT8), activated astrocytes (glial fibrillary acidic protein [GFAP]) and microglia (CD68) were used to determine the localization of Hic-5 and paxillin in AD brains.

2016年1月23日 · AT8是一种PHF-tau特异性单克隆抗体，由于其识别异常磷酸化的tau而成为神经病理学的常用标记。 先前的报道将AT8表位描述为包括pS202 / pT205。 我们的研究通过还将pS208鉴定为结合表位的一部分，支持并扩展了先前的发现。

2021年5月11日 · Immunofluorescence analysis using Phospho-Tau (Ser202, Thr205) Monoclonal Antibody (AT8) (Product # MN1020), shows plasma membrane and cytoskeleton localization in SH-SY5Y cells treated with retinoic acid as compared to untreated SH-SY5Y cells which is reported to be low to negative for PhosphoTau expression.

Immunohistochemistry with the AT8 antibody showing phosphorylated tau (Ser202/Thr205) in the frontal cortex (FC; A,E,I,M,Q), hippocampus (HP; B,F,J,N,R), entorhinal cortex (EC; C,G,K,O,S) and...

激光捕获显微镜用于选择免疫染色的脑薄切片中的特定细胞类型，然后使用 NanoString 技术识别和量化年龄匹配的对照和 AD 神经元样本之间 mRNA 水平的差异。 还使用双重标记技术对从表达致病性过度磷酸化 AT8 阳性 (AT8+) tau 和非 AT8+ AD 神经元的 AD 脑切片分离的神经元进行了比较。 mRNA 表达数据显示了捕获的神经元亚型之间代谢途径表达的独特模式，这些亚型涉及基于膜的溶质转运蛋白、氧化还原因子以及精氨酸和蛋氨酸代谢途径。 我们还鉴定了一种新的代 …

阿尔兹海默症 （Alzheimer’s disease, AD）是众所周知的严重威胁患者生存质量的神经退行性疾病，其病理特征主要为 β-淀粉样蛋白 （Aβ）的淀粉样斑块（plaques）和微管结合蛋白Tau形成的 神经纤维缠结 （neurofilament tangle, NFT）。 尽管多项研究已证实Aβ的重要性，但截至目前，针对Aβ治疗策略的研究已陷入僵局。 因此，越来越多的研究人员把目光集中在Tau。 在AD疾病发展过程中，病理性神经元纤维Tau聚集体显示出 朊病毒样特征，即起始聚集的“种 …

2021年12月27日 · Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质三维结构信息以及染色质调控元件相互作用图谱。 Hi-C可以与RNA-seq、ChIP-seq、ATAC-seq和WGBS（全基因组甲基化测序技术）等数据进行联合分析，从基因调控网络和表观遗传网络来阐述生物体表型形成的相关机制。 而其中ATAC-seq技术 …

2023年9月20日 · 本文讲述了HIC数据预处理的三种工具：Hicup、ALLHiC和juicer，涉及软件安装、数据清洗和比对步骤，以优化HIC数据分析过程。 以上三种方法，选择一种，完成HIC数据预处理工作。 这一步是所有二代数据都要做的，使用 软件 Trim_galore和 fastqc，修剪低质量的碱基和接头序列，过滤低质量的Reads。 可以使用seqkit软件做fastq文件的统计，很方便快速。 这里预处理的意思是：对HIC数据中嵌合体序列进行修剪，与contig水平基因组比对（通常单端比对， …

2025年1月13日 · 原文：将比对后的 BAM 文件转换为 Hi-C 数据矩阵，矩阵存储在 HDF5 文件中，可以快速访问和分析。 解读：这是分析流程的核心步骤。 你需要通过以下命令构建交互矩阵： --samFiles：输入的 BAM 文件，可以是多个样本。 --binSize：设置矩阵的分辨率（每个 bin 的大小，单位为碱基）。 --outFileName：生成的矩阵文件名称（.h5 格式）。 --inputBufferSize：优化读取数据的速度。 输出：一个包含基因组交互信号的矩阵文件，用于后续分析和 可视化。 4. 可 …

2022年7月12日 · 研究人员对tau蛋白 的 AT8 表位内的关键残基T205进行了分析研究。 通过CRISPR-Cas9敲除小鼠模型，研究人员证实了在 T205可调节多个表位的生理性 tau蛋白磷酸化，并且在体外培养细胞中预测的位点相互依赖性适用于脑组织中的内源性 tau蛋白。