2021年7月28日 · 注意力机制是注意力计算规则能够应用的深度学习网络的载体, 同时包括一些必要的全连接层以及相关张量处理, 使其与应用网络融为一体. 使用自注意力计算规则的注意力机制称为自注意力机制. 说明: NLP领域中, 当前的注意力机制大多数应用于seq2seq架构, 即编码器和解码器模型. 在解码器端的注意力机制: 能够根据模型目标有效的聚焦编码器的输出结果, 当其作为解码器的输入时提升效果. 改善以往编码器输出是单一定长张量, 无法存储过多信息的情况. 在编码器 …

2023年9月14日 · 本文详细介绍了在PyTorch中使用torch.mm (),torch.bmm ()和torch.matmul ()进行矩阵乘法的方法，包括函数定义、参数、示例以及它们在处理不同维度张量时的行为和广播机制。

2024年6月20日 · Motif分析是一种在 生物信息学 和计算生物学中广泛应用的技术，用于识别DNA、RNA或蛋白质序列中具有生物学功能的短保守序列模式（motif）。 这些motif通常与特定的生物学功能相关，如DNA中的转录因子结合位点、RNA中的剪接位点或蛋白质中的功能结构域。 在DNA或蛋白的同源序列中，不同位点的保守程度是不一样的，一般来说，对DNA或蛋白质功能和结构影响比较大的位点会比较保守，其它位点则不是很保守。 这些保守的位点就称为“模 …

SelfAttention import torch import torch.nn as nn from math import sqrt # torch.bmm 专用于批量矩阵乘法，适用于形状为 (batch_size, n, m) 和 (batch_size, m, p) 的 3D 张量。 # torch.matmul 支持更灵活的…

2005年5月1日 · The brummer (bmm) gene encodes the lipid storage droplet-associated TAG lipase Brummer, a homolog of human adipocyte triglyceride lipase (ATGL). Food deprivation or chronic bmm overexpression depletes organismal fat stores in vivo, whereas loss of bmm activity causes obesity in flies.

2019年6月3日 · Bmm is the Drosophila homolog of mammalian adipose TAG lipase (ATGL), an enzyme that is critical for lipolysis (Grönke et al., 2005). Bmm plays an essential and conserved role in TAG breakdown and, subsequently, fatty acid mobilization, from lipid droplets in fat storage tissues during metabolic adaptation (Grönke et al., 2007).

Bone marrow-derived macrophages (BMM) comprise a population of quiescent cells which can be activated by defined signals. Here, we directly compare the release of chemokines and monokines by BMM raised either in serum-supplemented or in serum-free medium in response to Listeria monocytogenes EGD or Mycobacterium bovis BCG infection.

TatARRB2 (23), a cell-permeable peptide that contains the MAPK JNK-binding motif from within the ARRB2 C-domain, impaired ARRB2 interaction with JNK3, down-regulated C1q expression and permitted factor-independent survival in BMM, thus suggesting that this peptide antagonises ARRB2 function in macrophages.

2025年2月10日 · torch.bmm ()强制规定维度和大小相同. torch.matmul ()没有强制规定维度和大小，可以用利用广播机制进行不同维度的相乘操作. 当进行操作的两个 tensor 都是3D时，两者等同。 官网： https://pytorch.org/docs/stable/torch.html#torch.bmm. torch.bmm ()是tensor中的一个相乘操作，类似于矩阵中的A*B。 参数： input，mat2：两个要进行相乘的tensor结构，两者必须是3D维度的，每个维度中的大小是相同的。 output：输出结果. 并且相乘的两个矩阵，要满足一 …

2018年5月28日 · The BaMM web server offers four tools: (i) de-novo discovery of enriched motifs in a set of nucleotide sequences, (ii) scanning a set of nucleotide sequences with motifs to find motif occurrences, (iii) searching with an input motif for similar motifs in our BaMM database with motifs for >1000 transcription factors, trained from the GTRD ChIP ...