
BRD4-targeting PROTAC as a unique tool to study biomolecular
2023年5月9日 · In this study, we employed a BRD4-targeting PROTAC molecule to regulate the super-enhancer (SE) condensate and monitored the changes of SE condensate under PROTAC treatment using live-cell...
Design of a Cereblon construct for crystallographic and …
2024年10月15日 · We present the design of CRBN midi, a construct that readily expresses from E. coli with high yields as soluble, stable protein without DDB1. We benchmark CRBN midi for wild-type functionality...
人基因组中目前600 多种E3 酶. 主要用于PROTAC 设计的E3 酶: MDM2、IAPs、VHL、CRBN.... Geyer, M. et al. J. Biol. Chem. 2009, 284, 36547-36556. BRD4: 含溴结构域蛋白家族中的一员(Bet proteins: BRD2、BRD3、BRD4 and BRDT). BRD4-PROTAC...
An engineered cereblon optimized for high-throughput screening …
2025年2月20日 · To investigate CRBN_ΔHBD activity in ternary complex formation assays the bromodomain-containing protein 4 (BRD4) PROTAC dBET6 18 was selected (Table S1). Spectral shift assays were optimized to directly calculate the K D and apparent cooperativity value (alpha) in the presence of the first bromodomain of purified BRD4 (BRD4-BD1, aa 42–168 ...
The cyclimids: Degron-inspired cereblon binders for targeted …
2024年6月20日 · Here, we report that the cyclimids, ligands derived from the C-terminal cyclic imide degrons of CRBN, exhibit distinct modes of interaction with CRBN and offer a facile approach for developing potent and selective bifunctional degraders.
【Nature】新型分子内二价胶靶向降解BRD4 - 知乎
在这里,我们利用正交遗传筛选、生物物理表征和结构重建,研究了 BRD2 和 BRD4 双功能降解剂,称为分子内二价胶 (IBG,intramolecular bivalent glues)的作用机制,并发现它不像 PROTAC 那样以反式连接靶标和连接酶,它们同时以顺式方式接合并连接靶标蛋白的两个相邻结构域。 这种构象变化将 BRD4“粘合”到 E3 连接酶 DCAF11 或 DCAF16,利用内在的靶标E3连接酶亲和力,在没有化合物的情况下不会转化为 BRD4 降解。 对三元 BRD4- IBG1 -DCAF16 复合物的结构指 …
CRBN配体的作用和最新进展 - 知乎 - 知乎专栏
最新的AACR会议上,已经有一批公司使用新型CRBN配体,包括 Arvinas公司 的第二代AR降解剂ARV-766, C4公司 的BRD9 降解剂CFT8634和BRAF V600E降解剂CFT1946,以及Kymera的IRAK4降解剂KT474(图7)。 图7. 基于新型CRBN配体的PROTAC. CC-122(avadomide)也具有抗癌和免疫调节活性。 有两个课题组分别采用了CC-122的类似物用于PROTACs的设计中,如图8所示,Nurix公司在他们的专利中(WO 2021113557)发表了一类BTX降解剂,另外也有一 …
BRD4-specific PROTAC inhibits basal-like breast cancer partially ...
2024年8月20日 · We demonstrated that 6b (BRD4 PROTAC) suppresses BLBC cell growth by targeting BRD4, but not BRD2 and BRD3, for cereblon (CRBN)-mediated ubiquitination and proteasomal degradation. Compound...
靶标蛋白降解_产品_Promega微网站-普洛麦格(北京)生物技术有 …
利用活细胞终点法检测protac诱导的brd4 vhl/crbn三元复合物的形成和brd4蛋白水平 。 NanoLuc ® -BRD4供体质粒与HaloTag ® -VHL或HaloTag ® -CRBN受体质粒以1:100的比例转染细胞(BRD4 /VHL检测),用MG132预处理(或DMSO作为对照),随后再用1µM MZ1 (基于VHL的PROTAC)或DMSO溶液处理。
如何利用AlphaLISA tool box 建立PROTAC三元复合物结合实验?
为了证明检测到的alphalisa信号是特异于检测brd4、crbn复合物和protac之间三元复合物形成的结果,我们测试了几个对照分子,包括 沙利度胺 和 jq1 (分别与crbn复合物和brd4结合)以及一个无关的protac分子 mt-802 。