BWA，即Burrows-Wheeler-Alignment Tool。是一种能够将差异度较小的序列比对到一个较大的参考基因组上的软件包。下面给大家简单介绍一下如何使用BWA进行序列比对！ BWA包括三种算法： BWA-bactrack：是为illumina序列所设计的，读数最大长度到100bp；

博格华纳公司（纽交所：bwa）是美国汽车零部件供应商，总部位于密歇根州的奥本山。 公司在全球24个国家的96个地区拥有制造和技术中心，在全球拥有约50,000名员工（截至2021年2月23日）博格华纳是全球最大汽车零件供应商之一，位列全球汽车行业供应商前25名。

使用bwa aln或bwa mem 命令进行比对前，用 bwa index reference.fasta 命令将参考序列建立索引，并将产生的5个索引文件放在同一个目录中。 发布于 2018-04-24 13:14 赞同 3 1 条评论

2024年6月3日 · 今天给大家介绍一下BWA，Bowtie，Bowtie2比对算法的原理。 二代测序技术 或者说是 高通量测序技术 产生的数据有几个明显的特征：1是测序数据量大，2是序列比较短，3是测序错误一般可以控制在0.1%左右。那么如何快速将这些测序数据比对到参考基因组是一个比较 ...

做重测序时，把bwa生成的sam文件用samtools转成bam格式时报错，Parse error at line 6021 :sequence and …

2020年3月21日 · 比 bwa 等最先进的工具快 10-100 倍。 SNAP 大大减少了本地对齐检查的数量和成本 （使用更长的种子来减少错误 考虑正位置，利用更大的内存容量来加速索引查找，并在未完全计算的情况下排除大多数候选位置）。

而且速度还是bwa-mem的3倍左右，不过在上短序列比对的质量是不如bwa-mem的，甚至碰到错误率较高的测序结果时，速度反而慢。 按照李恒博士的说法是原因高错误率的测序结果会频繁触发minimap2的启发式（heuristics）操作，这个会很耗时间。

@a00129:524:hmcvwdsxx:2:1101:2013:1031 1:n:0:cagttgct+atatcgccggccgttcngcacgggctggatgatccgggttagta…

因为是自己野路子自己摸索的，我仿佛看到了自己的过往以及正在经历的点点滴滴，刚开始的时候我一直处在绝望的边缘，我甚至反复的问自己，我真的适合去学生信嘛？