
基于蛋白质半胱氨酸的活性蛋白表达谱分析 - 大学化学
2023年1月16日 · Vinogradova等人利用脱硫生物素-碘乙酰胺探针 (iodoacetamide-desthio-biotin,IA-DTB)结合串联质谱标签 (Tandem mass tags,TMT)标记和三级质谱 (MS 3)定量模式绘制了人类初级T细胞中易受亲电小分子共价修饰的蛋白质半胱氨酸图谱 [18]。
Global profiling of phosphorylation-dependent changes in …
2022年2月28日 · We found that immunoblotting of IA-DTB-enriched proteins with a monoclonal antibody no. 9146 that recognizes an epitope on MAP2K1 containing D282 mirrored our chemical proteomic results,...
Functionalizing tandem mass tags for streamlining click-based ...
2024年4月10日 · A Workflow currently used for profiling cysteines in which samples are labeled with either iodoacetamide-desthiobiotin (IA-DTB) or iodoacetamide alkyne (IAA) and conjugated to biotin azide via...
Proteomic discovery of chemical probes that perturb protein …
2023年4月20日 · Proteomes from DMSO- or compound-treated cells (20 μM compound, 1 h) were exposed to the broad-spectrum cysteine-reactive probe iodoacetamide-desthiobiotin (IA-DTB) and probe-labeled cysteines enriched and quantified by multiplexed (TMT) MS analysis. 32 Cysteines showing a substantial loss (>60%) in IA-DTB labeling in cells treated with one or ...
Multiplexed proteomic profiling of cysteine reactivity and ...
2021年6月18日 · Treat the resulting proteomes (500 μL, 1.5–2.0 mg/mL) with iodoacetamide polyethyleneoxide desthiobiotin (IA-DTB (Santa Cruz), 5 μL of 10 mM stock in DMSO, final concentration: 100 μM) for 1 h at ambient temperature.
A platform for mapping reactive cysteines within the ... - Nature
2024年11月8日 · Among these probes, iodoacetamide-PEG-desthiobiotin (IA-DTB) and desthiobiotin iodoacetamide (DBIA) are widely used in the activity-based protein profiling (ABPP) platform for profiling protein...
癌细胞中Tryptoline丙烯酰胺-蛋白质相互作用的多层化学蛋白质组 …
然后作者利用碘乙酰胺-脱硫生物素(IA-DTB)探针对5组炔基立体探针和2组不含炔基的竞争立体探针进行竞争性半胱氨酸导向的ABPP实验。 结果中可以鉴定到217个蛋白质上的238个半胱氨酸具有对应的立体选择性配体。 与蛋白质导向的ABPP结果整合可以发现,两种ABPP平台可以一定程度上作为互补的方法发现更多的立体探针-蛋白质相互作用。 最后,作者对ABPP平台鉴定到的几组立体探针-蛋白质相互作用进行了表征。 验证了立体探针会立体选择性靶向蛋白质上特定的半 …
Angewandte Chemie International Edition - Wiley Online Library
2019年11月29日 · Described here are easily synthesized isotopically labeled desthiobiotin azide (isoDTB) tags that shortened the chemoproteomic workflow and allowed an increased coverage of cysteines in bacterial systems.
碘乙酰胺探针IA-alkyne标记活性半胱氨酸(IA-alkyne-Hcy)
2024年11月22日 · 碘乙酰胺(iodoacetamide,IA)探针与炔基结合,形成IA-alkyne,通常用于标记蛋白质中的活性半胱氨酸残基。 这种探针通过特异性与半胱氨酸的巯基(-SH)反应,实现对其的标记,从而用于生物化学和分子生物学研究中,以便于检测和分析半胱氨酸及其在蛋白质和 ...
Chemical proteomic identification of functional cysteines with …
2021年3月3日 · Proteins were then digested with trypsin and IA-DTB-labeled peptides enriched with streptavidin beads, eluted, and modified with isobaric tandem mass tagging (TMT-10plex ™) to allow for multiplexed liquid chromatography (LC)-MS identification and quantification.