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植物萜类合酶研究新进展
Class II 类TPS活性残基存在独立的结构域并包含“DXDD” 基序, 该区域用于起始质子环化作用。 国家自然科学基金(31570302)和中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目(2016-I2M-3-016)。 (E-mail: [email protected])。 0 — — — 2 — — /: 表示到目前的研究中, 该栏中无成员; —: 表示该栏中暂无统计数据。 表中数据为全基因组分析结果。 但在已获得三维结构的TPS中 , Class II类酶的活性位点结构域被验证为无功能结构域(Starks 等1997)。
植物二萜合酶结构和功能研究进展 - 仁和软件
2018年8月1日 · 二萜合酶根据其功能域可分为两大类: Class Ⅰ类和Class Ⅱ类。 Class Ⅱ类二萜合酶特征功能域是DXDD, 这个富含天冬氨酸的催化功能域在二萜合酶中是保守的 [10]; GGPP在Class Ⅱ类二萜合酶催化下, 选择性地生成带有特殊立体构象的环状烃类结构, 如产物柯巴基焦磷酸 (copalyl diphosphate, CPP), 目前已知的有 nor -CPP、 ent -CPP、 syn -CPP三种不同的构象 [11 - …
Analysis of Terpene Synthase Family Genes in Camellia sinensis …
2020年1月22日 · Moreover, these genes contain the specific protein features of TPS gene family, such as the ‘DDXXD’ and ‘NSE/DTE’ motifs (Supplementary Table S4), which are important for metal dependent ...
Monoterpene and sesquiterpene synthases and the origin of …
2009年10月1日 · The best known structural motif of the terpene synthase family is an aspartate-rich region, DDxxD, found in virtually all isolated plant terpene synthases as well as in isoprenyl diphosphate synthases and microbial terpene synthases.
Genome-wide detection of terpene synthase genes in holy basil
2018年11月16日 · The DDXXD motif is present on the N-terminal region of positional 35 amino acid downstream to RXR/RDR motif; it plays a role in the complexation of the diphosphate group after ionization of substrate.
植物TPS酶基因家族的分类及物种分布 « 数字生活
2022年5月1日 · i类tps酶的催化活性位点位于α结构域的ddxxd和nse/dte基序,同时其拥无活性位点的β结构域,除被子植物外,其他植物的i类tps还可能拥有另一个无活性位点的γ结构域。
Investigating the conservation pattern of a putative second …
Terpene synthases (TPS) require divalent metal ion co-factors, typically magnesium, that are bound by a canonical DDXXD motif, as well as a putative second, seemingly less well conserved and understood (N/D)DXX (S/T)XXXE motif.
植物萜类合成酶及其代谢调控的研究进展 - 百度文库
有一个天冬氨酸富集基序( DDxxD ) ,这个基序被认为起到结合金属离子的作用( Sacchettini & Poulter,1997) ,它定位在活性位点的入口处,在引导底物催化时发挥重要的作用,若基序发生突变 则会导致酶催化活性的下降或产生异常的产物。
A. Known TPS motifs-RxR (red), DDxxD (purple) and NSE
The two conserved Arginines in the RxR motif are shown along with the metal-binding residues in the DDxxD (DDxx (D,E)) and NSE/DTE motifs (Rxx (N,D)Dxx (S,T,G)xxxE). The Arginine in the expanded...
植物萜类合成酶及其代谢调控的研究进展 - 豆丁网
2011年3月11日 · 有一个天冬氨酸富集基序(DDxxD),这个基序被认为起到结合金属离子的作用(Sacchettini & Poulter,1997),它定位在活性位点的入口处,在引导底物催化时发挥重要的作用,若基序发生突变