Ensembl is a genome browser for vertebrate genomes that supports research in comparative genomics, evolution, sequence variation and transcriptional regulation.

为什么要进行ID转换呢？不同的ID类型有不同的应用场景，Entrez ID常用来进行富集分析如GO，KEGG和GSEA。Gene symbol可被研究者们快速辨认。Ensemble ID具有唯一性常常用来转换成其他ID。接下来让我们一起学习如何进行他们之间的转换。 二.基因ID类型转换 1.

Stable IDs are created in the form ENS[species prefix][feature type prefix][a unique eleven digit number]. For example a mouse gene might be ENSMUSG#####. This means that we can immediately tell from a stable ID what kind of feature they refer to and what species they are in. The prefixes are listed on our prefix page. Versioning

2019年6月14日 · 下载gene序列时fa格式内的ID. gi|4557284|ref|NM_000646.1|[4557284] 格式说明：gi ：”GenBank Identifier的缩写”, 是序列的ID号，标识符。唯一的。4557284 就是该序列的gi号ref :标示该序列是参考序列。NM_000646.1 该序列的Accession号和版本号. 其他ncbi的id. taxid：物种id，比如人是7505

2016年2月17日 · Ensembl和NCBI都是盛名的基因组研究机构，提供相关的基因组结构注释文件，比如gtf或者gff，但注释的id却不是统一的。比如基因ID，Ensembl有Ensembl gene id，NCBI有entrez gene id。不同的人用的基因注释文件来源不同，就需要进行转换。本文主要讲如何利用Ensembl的Biomart，下载对应关系。

一般来说在处理 GEO 的芯片数据的时候，在处理 TCGA 或者 ICGC 的高通量数据的时候，会遇到基因名字是 Ensembl_ID 的情况，而写文章作图展示需要使用 Symbol ，这时候就出现转换的难题了。若干教程都谈到了这一点，本文稍作整理。

2021年6月17日 · Ensemble ID由物种符号和版本号组成，允许在特征变化时保持唯一性。文章详细讲述了三种转换Ensemble ID的方法：bitr、select和biomaRt，并提供了相关转换操作的代码示例。此外，还提到了在某些情况下，biomaRt可能提供更更新的数据进行转换。

2024年12月25日 · 生物信息学之rnaseq转录组分析--转换文件中的ensemble id到gene名如何解决转录组分析中count之后遇到ensemble id的问题一个将ensemble id转换成gene名的python 脚本 如何解决转录组分析中count之后遇到ensemble id的问题 亲亲们好，我们做生物信息转录组分析的时候，可以走如下流程鸭： 1.获取fastq或者fasta原始文件 ...

Ensemble ID Ensemble ID 是Ensembl 数据库使用的ID标识符，用于标识不同的分子特征，如基因，转录本，外显子，蛋白。大多数据库都有一套自己的ID命名。ID 主要是为消除歧义，在特征注释或数据库更新时也能保持一致。不像人为命名的分子名字，如基因名字那样可能发生改变。

2021年4月8日 · Ensemble id：由欧洲生物信息数据库提供，一般以ENSG开头，后边跟11位数字。如TP53基因：ENSG00000141510 Entrez id：由美国NCBI提供，通常为纯数字。如TP53基因：7157 Symbol id：为我们常在文献中报道的基因名称。