gmx spol - GROMACS 2025.1 documentation
gmx spol analyzes dipoles around a solute; it is especially useful for polarizable water. A group of reference atoms, or a center of mass reference (option -com) and a group of solvent atoms is …
Gromacs 中文手册目录 - 知乎 - 知乎专栏
F.1 gmx anadock:根据Autodock运行计算团簇结构 251; F.2 gmx anaeig:分析简正模式 251-254; F.3 gmx analyze:分析数据集 254-257; ... F.82 gmx spol:分析溶质周围溶剂的偶极取向及极化 …
gmx spol — GROMACS 2021.4 documentation
gmx spol analyzes dipoles around a solute; it is especially useful for polarizable water. A group of reference atoms, or a center of mass reference (option -com ) and a group of solvent atoms is …
GROMACS命令详解-CSDN博客
2022年1月17日 · **gmx_MMPBSA工具详解** gmx_MMPBSA是针对分子模拟领域的一款高效工具，它结合了AMBER的MMPBSA.py和GROMACS的强大功能，用于进行最终状态自由能的计 …
gmx-spol (1) — gromacs-data
gmx spol analyzes dipoles around a solute; it is especially useful for polarizable water. A group of reference atoms, or a center of mass reference (option -com) and a group of solvent atoms is …
GROMACS程序文档|Jerkwin
大多数GROMACS程序都可以处理原子数比输入运行文件或结构文件中的原子数少的轨迹, 但轨迹只能包含输入运行或结构文件中的头n个原子.
gmx-spol: Analyze solvent dipole orientation and polarization …
gmx spol analyzes dipoles around a solute; it is especially useful for polarizable water. A group of reference atoms, or a center of mass reference (option -com) and a group of solvent atoms is …
molecular dynamics simulation suite - GROMACS 2024.3 …
GROMACS is a full-featured suite of programs to perform molecular dynamics simulations, i.e., to simulate the behavior of systems with hundreds to millions of particles using Newtonian …
Gromacs的操作指令（总结自网络，慢更ing） - 知乎专栏
gmx spol - 分析溶质周围溶剂的偶极取向及极化. 2.5. 结构中的距离随时间的变化. gmx mindist - 计算两组间的最小距离. gmx mdmat - 计算残基接触映射图. gmx polystat - 计算聚合物的静态性 …
Gromacs 中文手册目录 - CSDN博客
2020年12月28日 · F.1 gmx anadock:根据Autodock运行计算团簇结构 251. F.2 gmx anaeig:分析简正模式 251-254. F.3 gmx analyze:分析数据集 254-257. ... F.82 gmx spol:分析溶质周围溶剂 …
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