
HTqPCR - Oxford Academic
2009年10月6日 · HTqPCR is a software package amenable to the analysis of high-density qPCR assays, either for individual experiments or across sets of replicates and biological conditions.
ht-qpcr检测原理 - 百度文库
HT-QPCR技术则是在实时荧光定量PCR的基础上,结合高通量技术,实现对多个样本的同时检测和分析。 HT-QPCR检测技术具有高灵敏度、高特异性和高通量等优点,被广泛应用于基因表达分析、突变检测、病原微生物检测等多个领域。
摘要: 高通量定量PCR 的原理是在模板DNA 的PCR反应体系中加入荧光基团,进行高温变性,低温复性,适温延伸的热循环聚合酶链式反应。 高通量定量PCR包括染料法和探针法,其通过荧光信号实时监测PCR 反应进程,实现荧光信号积累与PCR产物形成同步,进而求得Ct值,获得扩增曲线和溶解曲线。 同时利用已知模板浓度的标准品做对照,进而获得未知样本目的基因拷贝数。 功能基因高通量定量PCR方法是基于日本TAKARA 公司SmartChip微孔芯片可进行高通量、高密度、纳升级别的 …
MPB:中科院城环所苏建强、朱永官等-功能基因高通量定量方法-C…
2021年1月26日 · 高通量定量PCR包括染料法和探针法,其通过荧光信号实时监测PCR反应进程,实现荧光信号积累与PCR产物形成同步,进而求得Ct值,获得扩增曲线和溶解曲线。 同时利用已知模板浓度的标准品做对照,进而获得未知样本目的基因拷贝数。 功能基因高通量定量PCR方法是基于日本TAKARA公司SmartChip微孔芯片可进行高通量、高密度、纳升级别的实时定量PCR的方法。 高通量定量PCR需要采用纳升级多样品自动加样器将样品分配到微孔芯片上,并通过高 …
Contributions and Challenges of High Throughput qPCR for …
High throughput qPCR (HT-qPCR) is a relatively rapid and convenient method for the simultaneous evaluation of a large number of ARGs. Comprehensive analysis of different ARGs is essential to decipher the intricate relationship between ARGs, MGEs and other complex and overlapping environmental factors.
The impacts of different high-throughput profiling approaches …
2019年11月25日 · HT-qPCR approach has the superiorities of time-saving, absolute quantification, low requirement for bioinformatics skills but also has some drawbacks including higher PCR amplification & primer bias, higher primer dependency and relative lower ARG subtype quantification capability compared to metagenomic approach.
美格基因·新品解析 | MRG芯片:一种基于高通量qPCR的重金属抗 …
本文介绍了一种新的高通量定量 聚合酶链式反应 (HT-qPCR)芯片—金属抗性基因(MRG)芯片,用于9种金属稳态相关基因的定量研究。 MRG芯片包含77个新设计的简并引物和9个已发表的引物,覆盖56个金属抗性基因。 分类覆盖率的计算评估表明,MRG芯片覆盖范围广,涵盖2个界、29个门、64个纲、130个目、226个科和382个属。 温度梯度PCR和HT-qPCR验证了57℃为最佳退火温度,超过94%以上的引物扩增效率达到80~110%,R2>0.993。 HT-qPCR的计算评估和 …
使用BioC软件包分析qPCR数据_r语言 htqpcr包使用-CSDN博客
2014年4月23日 · 本文详细介绍了如何使用BioConductor中的HTqPCR和ddCt软件包来分析非标准化qPCR数据,包括数据整理、读入、Ct值的归一化处理和差异表达分析,适合对R语言不熟悉的生物信息学研究者参考。
Contributions and Challenges of High Throughput qPCR for ... - PubMed
2019年1月3日 · Expansion in whole genome sequencing and subsequent increase in antibiotic resistance targets have paved the way of high throughput qPCR (HT-qPCR) for analyzing hundreds of antimicrobial resistance genes (ARGs) in a single run. A meta-analysis of 51 selected studies is performed to evaluate ARGs abu …
Global trends in ARGs measured by HT-qPCR platforms
2020年1月1日 · High-throughput qPCR technology offers cost-effectiveness and high-throughput DNA amplification with efficient use of sample/DNA for monitoring AMR. The technology has already been applied in many studies for analyzing hundreds of antimicrobial-resistance genes (ARGs) in various types of samples.