
如何用gmx make_ndx将盒子中的不同物质分组 - 分子模拟 …
2024年9月23日 · 先用make_ndx 做个有环糊精组的index.ndx文件,之后rms时-n index.ndx 再选那一组。 不用再模拟,分个组就 ...
GROMACS中的组概念 - 知乎 - 知乎专栏
创建索引组的命令:gmx make_ndx. GROMACS的索引文件, 即index文件, 扩展名为.ndx, 可使用gmx make_ndx程序生成. 索引文件中, 原子编号都是从1开始的. 运行make_ndx后, 可使用r选择 …
Gromacs make_ndx建组问题 - CSDN博客
2024年1月4日 · gmx make_ndx -f input.gro -o output.ndx -select 'chain A' 上述命令将选择链标识为 A 的所有原子。 以上示例提供了一些常见的用法,您可以根据实际需要进行调整。
make_ndx 怎么用 - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计算化学公社
2020年2月13日 · 老师您好,我在用gmx make_ndx -f 1.pdb -o index.ndx 定义某个组的时候,执行完这个命令以后会出现如下 ...
求助make_ndx无法创建新的组 - 分子模拟 (Molecular Modeling)
2024年12月10日 · 目前已经通过卢天老师的指导课程进行到gmx make_ndx -f pr.gro 这个步骤,但是怎么样都无法创建新的组,我想将蛋白质,小分子还有铜离子构建成一个组,即1 13 14, …
How to create an index file in GROMACS - Compchems
2022年8月25日 · What you can do in GROMACS is to generate an index file (index.ndx), and create a new group containing only the parts you are interested in. You can use the gmx …
关于make_ndx、tc-grps分组设置问题 - 分子模拟 (Molecular …
2020年12月27日 · 关于make_ndx设置,tc-grps及energygrps这部分,我不太清楚该如何去选择设置,我做的体系是含有活性金属的,在设置蛋白与非蛋白组时,NFH是配体,CA和ZN是金属离 …
How to perform "gmx make_ndx" with single command line …
2021年12月28日 · How to perform "gmx make_ndx" with single command line bypassing the interactive shell? Upon creating the index file with gmx make_ndx, we are usually prompted …
【Computer Vision】角点检测和匹配——Harris算子
2017年7月11日 · Harris 算子是 Haris & Stephens 1988年在 "A Combined Corner and Edge Detector" 中提出的 提出的检测算法, 现在已经成为图像匹配中常用的算法. 对于一幅RGB图像 …
索尼IMX系列图像传感器技术分析 - MEMS/传感技术 - 电子发烧友网
2022年12月26日 · 随后,Sony推出了目前第四代全新CMOS芯片系列中的初代 产品 ——IMX系列,该系列显著提升了动态范围,当时引起了市场轰动。 IMX系列初代芯片优势: a.可缩短曝光 …