Merqury评估基因组质量 - 简书
2021年3月1日 · 一款新的软件Merqury, 基于Kmer的方法进行鉴定，据文章说是目前最牛叉的，现就consensus quality value (QV) 评估进行说明， 其中图b的红色区域，用于鉴定QV，Q30等 …
merqury:基因组完整度和组装质量评估 - 知乎 - 知乎专栏
介绍：Merqury是一种基于 k-mer 的基因组组装质量评估工具，通过基因组组装的一致性质量值（QV）评估组装的准确度，通过k-mer的多样性和计数图以及完整度值（completeness）评估 …
基因组组装评估 --- Merqury - JWei's Blog
2022年3月19日 · Merqury 生成的指标有 一致性质量（QV） 和 k-mer 完整性。 当亲本基因组序列可用时（组装或未组装）， Merqury 可以输出单倍型完整性、相位块统计、切换错误率以及 …
marbl/merqury: k-mer based assembly evaluation - GitHub
Often, genome assembly projects have illumina whole genome sequencing reads available for the assembled individual. The k-mer spectrum of this read set can be used for independently …
Merqury: reference-free quality, completeness, and phasing …
2020年9月14日 · Unique to Merqury, the generated metrics include consensus quality (QV) and k-mer completeness, and when parental genomic sequences are available (either assembled or …
「基因组」Merqury评估基因组 - 简书
2023年4月11日 · qv值和完整性影响因素： 完整性：QV高，完整性不一定高，跟物种的杂合度可能也有一定关系。 目前发现如果二代和三代基因组不是一个样本，merqury评估结果较差。
lh3/yak: Yet another k-mer analyzer - GitHub
Yak is initially developed for two specific use cases: 1) to robustly estimate the base accuracy of CCS reads and assembly contigs, and 2) to investigate the systematic error rate of CCS …
基因组组装质量评估之merqury——KAT升级版 - 知乎
merqury是评估基因组质量的一个新工具，基于Kmer对基因组进行评估，获得一致性质量（QV），组装完整度（通过Kmer_multiplicity & Count 图和comleteness值获得）。可以无参 …
生信 | 基因组组装实战（三）：Kmer评估基因组 - 简书
2021年6月15日 · 也就是基因组大小=（基因切割的Kmer数目）/（主峰深度） 杂合和重复会影响统计，而一般的基于Kmer预估基因组的软件会对此做处理,让结果更贴近真实。
Merqury：利用k-mer评估基因组组装质量的利器 - CSDN博客
2024年10月10日 · merqury是评估基因组质量的一个新工具，基于Kmer对基因组进行评估，获得一致性质量（QV），组装完整度（通过Kmer_multiplicity & Count 图和comleteness值获得）。 …