LOPIT provides a new tool that will enable preliminary functional assignment to uncharacterized proteins, based on their determined localization. LOPIT can also be used for the accurate determination of an organelle’s protein complement, which will facilitate the investigation of organelle function and protein trafficking.

2006年11月16日 · LOPIT is a novel proteomic tool that was originally developed for confident and parallel localization of integral membrane proteins within the organelles of the...

Localization of organelle proteins by isotope tagging is a new tool for high-throughput protein localization, which is applicable to a wide range of research areas such as the study of organelle function and protein trafficking. We describe a proteomics method for determining the subcellular localization of membrane proteins.

人原代成纤维细胞感染hcmv后，在120小时的时间过程中，每24小时通过同位素标记(lopit)图谱定位细胞器蛋白，跟踪细胞器重排。 该分析揭示了与病毒增殖和细胞器重排相关的单个蛋白质易位。

2021年12月1日 · Localization of Organelle Proteins by Isotope Tagging (LOPIT) and its variants are proteome-wide techniques, not matched in scale by microscopy-based or proximity tagging-based techniques, allowing holistic mapping of protein subcellular location and re-localization events downstream of cellular perturbations.

2023年12月23日 · 1、 LoRNA 和 dLOPIT 首次允许对全细胞转录组和蛋白质组的亚细胞定位进行同时分析。 2、全细胞RNA定位特别适用于研究刺激后的RNA再分布特征。 3、 eIF3d 是 UPR 后定位于膜周边的 肌动蛋白细胞骨架 成分持续翻译所必需的。 近日，英国剑桥大学的 Anne Willis教授 团队在《Nature methods》杂志上发表了名为“ System-wide analysis of RNA and protein subcellular localization dynamics ”的文章。 RNA和蛋白质的亚细胞动力学是细胞稳态的关键决 …

2019年2月11日 · 最近通过整合样品制备，质谱数据采集和蛋白质定位开发了一种新的方法叫做超融合的LOPIT (hyperLOPIT)。 这种方法对蛋白质亚细胞定位谱图的鉴定创建了更高的分辨率。 但是HyperLOPIT的工作流程较复杂，实验材料相对消耗过多。 所以作者想通过与差速离心的方法与HyperLOPIT优质的方法相结合，创造出起始材料少，更高分辨率的蛋白质定位方法。 为了创建这种方法，作者在分离细胞组分的时候采用了差速离心的方法，这种方法比密度梯度离心节约了 …

通过把LOPIT方法、自由流 电泳技术 （FFE）与质谱技术相结合，Dynamic endomembrane organellar profiling能大规模定性和定量分析不同亚细胞器蛋白质；并能精确分离高尔基体不同组分如cis-Golgi, medial-Golgi, 和 trans-Golgi蛋白质。

2019年1月18日 · 通过同位素标记对细胞器蛋白进行超复合定位 (hyperLOPIT) 是该领域成熟的方法。 它实现了细胞器和亚细胞区室的高分辨率分离，但相对耗时和资源密集。 作为一种更简单的替代方案，我们在此开发了差速超速离心后通过同位素标记对细胞器蛋白进行定位 (LOPIT-DC)，并将该方法与基于密度梯度的 hyperLOPIT 方法进行比较。 我们确认，使用差速离心可以获得亚细胞器和蛋白质复合物水平的高分辨率图谱。 HyperLOPIT 和 LOPIT-DC 产生高度相似的结果， …

One method that provides a global picture of the cell is localization of organelle proteins by isotope tagging (LOPIT), which combines biochemical cell fractionation using density gradient ultracentrifugation with multiplexed quantitative proteomics mass spectrometry, allowing simultaneous determination of the steady-state distribution of ...