
meRIP-qPCR - 知乎 - 知乎专栏
RNA甲基化免疫共沉淀 (Methylated RNA Immunoprecipitation,MeRIP)基于m6A特异性抗体识别并结合mRNA上的m6A的原理,以 RNA免疫共沉淀 方法富集甲基化修饰片段为基础,并通过 高通量测序 及 qPCR ,在全转录组范围内研究发生m6A甲基化修饰的RNA区域。
RIP-seq让m6A后期研究威力加倍 | RIP专题 - 搜狐
2020年5月21日 · 通过YTHDF1的RIP-seq以及m6A-seq后发现,使用IGV软件对两个组学数据同时进行可视化展示,CDK2和CDK4在转录本的起始位置和终止位置附近,两个组学的peak峰有了重叠( IGV和Adobe AI制作RIP-seq Peak图简易教程 | m6A专题 ),YTHDF1敲除后翻译效率显著降 …
干货:m6A RNA甲基化MeRIP-seq测序分析实验全流程解析 - 深圳 …
2022年6月24日 · 通过RIP实验(RNA结合蛋白免疫沉淀)和m6A-seq测序分析发现m6A被高度富集在突触素(Synaptophysin)的mRNA上,同时Synaptophysin的mRNA上有YTHDF1的结合位点。 早先的研究发现Synaptophysin和全麻药物的神经发育毒性紧密相关。
RNA结合蛋白研究技术:RIP-seq实验分析流程及案例分享 - 知乎
RNA免疫共沉淀—RIP-seq(RNA Immunoprecipititation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,RIP利用目标蛋白的抗体将相应的RNA-蛋白复合物(RBP)沉淀下来,分离纯化捕获的RNA,结合高通量测序技术对目标RNA进行…
Single-cell m6A mapping in vivo using picoMeRIP–seq - Nature
2023年6月22日 · Through optimized sample recovery and signal-to-noise ratio, we developed picogram-scale m 6 A RNA immunoprecipitation and sequencing (picoMeRIP–seq) for studying m 6 A in vivo in single cells...
你以为做完m6A测序后就完了?m6A-IP-qPCR了解下!|m6A专题
所谓 m6A-IP-qPCR 也叫MeRIP-qPCR,即利用 m6A抗体 在富集到带甲基化修饰的RNA后,下一步使用qPCR直接对富集到的RNA进行定量的一种技术。 这种技术可以做到对发生甲基化的RNA进行相对定量,是一种低成本的检测方法,仅需m6A抗体, A/G免疫磁珠, 磁力架 和 qPCR仪 及配套试剂盒即可开展这类实验。 第一步提取total RNA,作为可选步骤可以用 OligodT磁珠 富集带 polyA尾 的mRNA。 第二步将A/G免疫磁珠和m6A抗体按照试剂盒的标准步骤进行预混,配制 …
m6A甲基化RNA免疫沉淀试剂盒 | 锐博生物 - RiboBio
m6A甲基化RNA免疫沉淀(MeRIP)是一种检测m6A修饰状态并在全转录组范围内定位m6A RNA修饰位置的方法。 riboMeRIPTM m6A Transcriptome Profiling Kit 使用MeRIP方法进行m6A RNA修饰的鉴定和转录组分析。
易基因: m6A-seq+RIP-seq+ATAC等揭示YTHDF2通过整合RNA …
2024年12月11日 · 本研究通过rip-seq、rna-seq、m6a-seq、atac-seq等分析揭示了ythdf2在早期效应t细胞和效应样t细胞中选择性上调和重新分布;ythdf2缺失加剧了肿瘤进展,并对小鼠和人类的pd-1阻断治疗无反应性;ythdf2通过m6a依赖性rna衰变预防线粒体功能障碍;ythdf2与ikzf1/3互作 …
易基因: m6A-seq+RIP-seq+ATAC等揭示YTHDF2通过整合RNA …
2024年12月11日 · 本研究通过rip-seq、rna-seq、m6a-seq、atac-seq等分析揭示了ythdf2在早期效应t细胞和效应样t细胞中选择性上调和重新分布;ythdf2缺失加剧了肿瘤进展,并对小鼠和人类的pd-1阻断治疗无反应性;ythdf2通过m6a依赖性rna衰变预防线粒体功能障碍;ythdf2与ikzf1/3互作 …
Limits in the detection of m6A changes using MeRIP/m6A-seq
2020年4月20日 · The most common method to map m6A and to predict changes in m6A between conditions is methylated RNA immunoprecipitation sequencing (MeRIP-seq), through which methylated regions are detected as...