
科研 | Nature子刊:预测抗生素抗性基因在细菌基因组中的传播
2021年10月24日 · 根据其现有的mge谱,共有463种未观察到可转移arg的物种有可能获得可转移args(图3b)。 平均每个ARG可能转移到额外的164种,44属和21科,表明可转移耐药组仍有很大的传播潜力。
Co-occurrence of antibiotic and metal resistance genes revealed …
2016年12月13日 · In this study, by coupling a large complete genome collection with the powerful bioinformatics analyses, the genetic relationships between ARGs and MRGs across genome categories...
Duplicated antibiotic resistance genes reveal ongoing selection …
2024年2月16日 · Modeling and experiments show that antibiotic selection can drive the evolution of duplicated antibiotic resistance genes (ARGs) through MGE transposition. A key implication is that duplicated...
Forecasting the dissemination of antibiotic resistance genes across ...
2021年4月23日 · Antibiotic resistance spreads among bacteria through horizontal transfer of antibiotic resistance genes (ARGs). Here, we set out to determine predictive features of ARG transfer among bacterial...
Long-read metagenomic sequencing reveals shifts in associations …
2022年1月29日 · We applied long-read (nanopore) sequencing to profile ARGs and their neighboring genes to illuminate their fate in the activated sludge treatment by comparing their abundance, genetic locations, mobility potential, and bacterial hosts within activated sludge relative to those in influent sewage across five WWTPs from three continents.
Antibiotics resistance gene 抗生素抗性基因(ARG) - 简书
2023年5月24日 · 抗生素抗性基因(Antibiotics resistance genes,ARGs) 是指存在于细菌或其他微生物基因组中的基因,使它们具有对抗生素的抵抗能力。 这些基因编码了一系列的蛋白质或其他分子机制,使细菌能够对抗生素产生耐药性。 ARG被视为是一种新出现的生物污染物,由ARG引起的抗生素耐药性被认为是当代医学最重要的挑战之一,也是严重的公共卫生问题。 抗生素耐药性阻碍了临床上对细菌感染的有效治疗,并成为流行病威胁和高死亡率的原因。 根据获得的欧 …
Strain-level characterization of broad host range mobile genetic ...
2022年3月17日 · Mobile genetic elements (MGEs) carrying antibiotic resistance genes (ARGs) disseminate ARGs when they mobilise into new bacterial hosts. The nature of such horizontal gene transfer (HGT) events between human gut commensals and …
又双叒叕!五大数据库全方位注释,抗性宏基因组分析项目再次升 …
SARG (the structured ARG reference database)数据库,其由ARDB和CARD整合而成,目前更新到v2.3版本,是已知的最为完整的抗生素抗性基因数据库,根据不同基因抵抗抗生素的类型和基因的进化关系,将所有抗生素抗性基因分为type和subtype两个层级,其中type为基因所抵抗的抗生素类型(例如四环素抗性基因、磺胺抗性基因等),subtype为具体的抗性基因(例如tetA、sul1等)。 金属抗性基因(MRG)注释. BacMet 数据库全称为antibacterial biocide and metal …
重复的抗生素抗性基因揭示了细菌中水平基因转移-微生物安全与健 …
2024年9月19日 · 摘要: 本研究建模和实验表明,抗生素选择可以通过mge转座作用推动复制型抗生素抗性基因(args)的进化。 背景: 基因表达的选择可通过多种分子机制加速重复基因的进化,而基因复制被视为进化新功能和新性状的关键步骤,尤其在适应新代谢和生态位方面 ...
产品升级!宏基因组抗性基因传播转移分析方案 - 知乎
凌恩生物新开发的 宏基因组抗性基因转移分析 项目流程,包含五大数据库,全方位注释挖掘样本中的抗性基因,分别为抗生素抗性基因(sarg)、 金属抗性基因 (mrg)、 杀菌剂抗性基因 (brg)、 可移动基因单元 (mge)以及 细菌致病菌毒力因子 (vfdb)。
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