N50值是指在所有contigs中，长度至少为所有contigs长度总和一半的最短contig的长度。 一个较高的N50值意味着少数较长的contigs就能覆盖基因组的大部分，这通常表明组装的连续性更好， …

2017年9月18日 · N50、N90 举个例子，比如一个基因组大小是1M，测序得到若干条reads，这些reads进行拼接，如果完全可以拼接起来，中间没有gap的序列称为contig，即连续的意思。如 …

在 计算生物学 中，N50和L50是Contigs (重叠群)或脚手架长度的统计值。 N50的计算方式类似于平均值或中位数，但是对长Contigs的权重更大。 这种方法广泛运用于 序列组装 中，特别是 …

In computational biology, N50 and L50 are statistics of a set of contig or scaffold lengths. The N50 is similar to a mean or median of lengths, but has greater weight given to the longer contigs. It …

2023年6月16日 · N50、N90是评估基因组组装质量的指标。例如，一个1M基因组经测序拼接后，按长度从大到小排序，当累积长度达到总长度50%时，对应的那个contig或scaffold的长度即 …

2023年11月15日 · 基因组组装完成后，可通过n50或者busco，以及lai评估组装质量。本文就lai方法做一简单介绍。 基因组中的重...

QUAST (Quality Assessment Tool for Genome Assemblies)是基因组质量评估工具，通过计算各种指标来评估基因组的组装，包括 N50, L50， GC含量 等 contig 基本信息。 QUAST基 …

2016年7月27日 · 一般来说，contig/scaffoldN50越长，表示组装结果越好。 但是，N50指标高就意味着组装结果就一定可靠吗？ 不一定！ 将一些不相关的reads或者contig错误的连接 …

2024年2月19日 · N50值是指在所有contig（或scaffold）中，长度大于等于N50值的contig（或scaffold）的总长度占总长度的50%。 N90值类似，只是占总长度的90%。 一般来说，N50 …

2018年2月27日 · Contig N50和Scaffold N50. 对一条染色体进行测序，将测序得到的reads进行拼接，能够完全拼接起来，中间没有gap的序列称为contig。 如果中间有gap,但是gap的 长度我 …