2017年9月18日 · 然后把contig 和 scaffold 从长到短进行排列，然后相加，当恰好加到1M的50％，也就是500k的时候 ，那一条 contig 或者scaffold 的长度就叫做Contig N50和Scaffold …

N50值是指在所有contigs中，长度至少为所有contigs长度总和一半的最短contig的长度。 一个较高的N50值意味着少数较长的contigs就能覆盖基因组的大部分，这通常表明组装的连续性更好， …

In computational biology, N50 and L50 are statistics of a set of contig or scaffold lengths. The N50 is similar to a mean or median of lengths, but has greater weight given to the longer contigs. It …

2023年6月16日 · n50、n90是评估基因组组装质量的指标。 例如，一个1M基因组经测序拼接后，按长度从大到小排序，当累积长度达到总长度50%时，对应的那个contig或scaffold的长度即 …

在 计算生物学 中，N50和L50是Contigs (重叠群)或脚手架长度的统计值。 N50的计算方式类似于平均值或中位数，但是对长Contigs的权重更大。 这种方法广泛运用于 序列组装 中，特别是 …

2018年2月27日 · Contig N50和Scaffold N50. 对一条染色体进行测序，将测序得到的reads进行拼接，能够完全拼接起来，中间没有gap的序列称为contig。 如果中间有gap,但是gap的 长度我 …

2019年10月23日 · N50，L50和NG50是评价genome assembly的quality的标准，评价长度时使用N50，N50是一个contig的长度。 不选用genome size的50% 是因为1.这是估计的size值不一定 …

2024年2月19日 · N50值是指在所有contig（或scaffold）中，长度大于等于N50值的contig（或scaffold）的总长度占总长度的50%。 N90值类似，只是占总长度的90%。 一般来说，N50 …

2024年1月26日 · n50是一种用于评估基因组或序列组装质量的指标。 它表示序列组装中所有contigs或scaffolds的长度按照长度从大到小排列之后，第50%个序列的长度。 N50值越高

2017年8月18日 · 首先需要弄懂n50的定义。 n50就是把contig或scaffold从大到小排序， 并对其长度进行累加， 当累加长度达到基因组序列长度一半时， 最后一个contig或scaffold长度。 如果 …