
分子动力学模拟常用系综 - 知乎 - 知乎专栏
微正则系综 (micro-canonical ensemble),简写为 NVE ,表示具有确定的粒子数 (N)、体积 (V)、能量 (E)。 广泛应用于分子动力学模拟中,是孤立、保守的统计系综。 2. 正则系综 (NVT) 正则系综 (canonical ensemble),简写为NVT,表示具有确定的粒子数 (N)、体积 (V)、温度 (T)。 正则系综是蒙特卡罗方法模拟处理的典型代表。 3. 等温等压系综 (NPT) 等温等压系综 (constant-pressure, constant-temperature),简写为NPT,表示具有确定的粒子数 (N)、压强 (P)、温度 (T)。 4. 等 …
lammps教程:nve/nvt/npt系综设置方法 - 知乎 - 知乎专栏
系综是指大量性质和结构完全相同的、处于各种运动状态的、各自独立的系统的集合。 在lammps模拟中,常用的系综有nve、nvt、npt三种系综,下面说说这三种系综的使用方法。 1. nve(微正则系综)nve系综保证系统中原…
关于跑MD步骤的问题 - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计算化学 …
2021年4月24日 · 我看gromacs教程的一般流程都是:能量最小化,NVT控温,NPT控压,最后进行一个比较长的恒温恒压的成品模拟,我就很疑惑,既然最后都进行比较长的成品模拟了,为啥么还要之 ...,计算化学公社
了解lammps中NVE/NVT/NPT三种系综的特性和区别 - CSDN博客
2022年10月7日 · 在lammps模拟中,常用的系综有nve、nvt、npt三种系综,下面说说这三种系综的使用方法。 1. nve(微正则系综) nve系综保证系统中原子数量n、体系总体积v和体系总能量e保持不变。
分子动力学系综小结 - 知乎 - 知乎专栏
正则系综 (canonical ensemble),全称应为“宏观正则系综”,简写为NVT,即表示具有确定的粒子数(N)、体积(V)、温度(T)。 正则系综是 蒙特卡罗方法 模拟处理的典型代表。
Gromacs模拟中的NVT,NPT分别是什么含义?一文给你讲透它..._npt …
2025年3月16日 · 系综是指大量性质和结构完全相同的、处于各种运动状态的、各自独立的系统的集合。在lammps模拟中,常用的系综有nve、nvt、npt三种系综,下面说说这三种系综的使用方法。1. nve(微正则系综) nve系综保证系统中原子数量n、体系总体积v和体系总能量e保持不变。nve系综没有控温的功能,初始条件 ...
Molecular Dynamics: Ensembles - Compchems
2022年7月25日 · Learn about the various ensembles such as NVE, NVT, NPT and their application in MD simulations. Understand how they impact the thermodynamic properties of the biomolecular system, and how to implement them in your MD simulation using GROMACS.
求助NVT NPT过程的必要性 - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计 …
2016年3月2日 · 不管是nvt还是npt模拟,都有个预平衡阶段,对于生物大分子体系一般看rmsd是否收敛,对于小分子溶液体系一般看密度之类的量是否收敛,收敛之后的轨迹都可以用来分析统计。
【lammps】:nve/nvt/npt系综设置方法 - CSDN博客
2024年5月8日 · 本文详细介绍了LAMMPS软件中常用的三种系综(nve、nvt、npt)在原子模拟中的设置方法,包括它们各自的控制目标和使用示例。 作者强调了系综选择取决于模拟体系和目的,给出了nve适用于封闭系统和特定模拟场景的建议,并提到了nvt和npt在不同情况下的应用优势。
了解lammps中NVE/NVT/NPT三种系综的特性和区别 - 代码先锋网
在大多数模拟中,用nvt或者npt都可以。 以拉伸为例,使用deform进行拉伸,系综可以为nvt,也可以为npt,不过在npt下更有容易模拟泊松效应。 使用velocity方式进行拉伸,在拉伸方向只能为s边界,使用nvt系综更方便。