2025年1月20日 · This study presents a new quantitative method, CROWN-seq, to map the cap-adjacent RNA modification N6,2'-O-dimethyladenosine (m6Am) with single nucleotide resolution. Using thoughtful controls and well-validated reagents, the authors provide compelling evidence that the method is reliable and reproducible.

2021年8月6日 · Here, we report m6Am-seq, based on selective in vitro demethylation and RNA immunoprecipitation. m6Am-seq directly distinguishes m6Am and 5′-UTR N6-methyladenosine (m6A) and enables the ...

2018年11月30日 · 该文章鉴定了N6，2'-O-二甲基腺嘌呤（m 6 Am）的修饰酶——PCIF1，为进一步研究该动态、可逆修饰的生物学功能提供了新的思路。 RNA上存在一百多种化学修饰，其中N6-甲基腺嘌呤（m 6 A）作为真核生物mRNA上含量最普遍的化学修饰，参与调控了很多重要的生物学过程。 不同于m 6 A，m 6 Am主要位于真核生物mRNA 5'端帽子之后的第一个碱基。...

2023年2月2日 · In the absence of Mettl14, the cells display a robust increase in acetylation of histone H3 at lysine 27, stemming from significantly increased stability of mRNAs encoding H3K27 acetyltransferases CBP (CREB-binding protein) and p300, indicating that m6A indirectly impacts histone modifications and gene expression by destabilizing transcripts ...

2019年8月8日 · One of the most abundant mRNA modifications is N6,2-O-dimethyladenosine (m6Am). Here, we demonstrate that m6Am is an evolutionarily conserved mRNA modification mediated by the Phosphorylated CTD Interacting Factor 1 (PCIF1), which catalyzes m6A methylation on 2-O-methylated adenine located at the 5' ends of mRNAs.

2024年11月4日 · 该研究中，研究人员应用定量蛋白质组学筛选技术，鉴定出在 m6Am 修饰中具有优先结合能力的转录终止因子 PCF11。 PCF11 含有多个长度约 13 个氨基酸的 FEGP 基序，称为 “FEGP 重复序列 ”，这是确定 m6Am 结合特异性的关键。 这些特定的氨基酸序列仅在具备 m6Am 修饰的生物中存在进化保守性。 这暗示着 PCF11 的 FEGP 基序可能与 mRNA 的 m6Am 修饰共同进化，使其能够识别并结合于 mRNA 的 m6Am 位点。 在对 PCF11 功能的进一步研究中，作 …

2024年10月30日，深圳湾实验室 吴炜祥 课题组在 Molecular Cell 发表了题为 m6Am sequesters PCF11 to suppress premature termination and drive neuroblastoma differentiation 的研究论文。 该研究首次发现转录终止因子PCF11是特异识别m6Am的阅读器蛋白，揭示了m6Am通过与RNA聚合酶II（Pol II）竞争结合PCF11，从而调控转录的全新机制。 此外，研究还阐述了m6Am修饰在神经母细胞瘤治疗中的作用机制，进一步凸显了RNA修饰在癌症治疗领域的潜在应用价值。 作 …

2021年8月6日，北京大学伊成器团队在 Nature Communications 在线发表题为“ m6Am-seq reveals the dynamic m6Am methylation in the human transcriptome ”的研究论文，该研究报告了 基于选择性体外去甲基化和 RNA 免疫沉淀的 m6Am-seq方法。 m6Am-seq 直接区分 m6Am 和 5'-UTR N6-甲基腺苷 (m6A)，并能够以单碱基分辨率识别 m6Am 和人类转录组中的 5'-UTR m6A。 使用 m6Am-seq，该研究还发现 m6Am 和 5'-UTR m6A 对刺激有动态反应，并确定可能促进细 …

2024年10月31日 · This study is the first to identify the transcription termination factor PCF11 as a specific reader protein for m 6 Am, revealing a novel mechanism by which m6Am regulates transcription by competing with RNA polymerase II (Pol II) for binding to PCF11.

Here, we identify and biochemically characterize PCIF1, the methyltransferase that generates m 6 Am. We find that PCIF1 binds and is dependent on the m 7 G cap. By depleting PCIF1, we generated transcriptome-wide maps that distinguish m 6 Am and m 6 A.