PDBj (Protein Data Bank Japan) maintains the single global PDB/BMRB/EMDB archives of macromolecular structures and provide integrated tools, under the Joint Usage and Research activities of the Institute for Protein Research.

分子の顧客 Hsp90は厳選されたタンパク質だけを対象に成熟を助ける専門のシャペロンである。対象とするタンパク質には、ステロイド受容体（steroid receptor）、変異体p53（mutant p53）タンパク質、乳がんに関係するHER2タンパク質など百種類以上もの転写因子やリン酸化酵素（キナーゼ）が含まれる ...

日本蛋白質構造データバンク（PDBj: Protein Data Bank Japan） は、 大阪大学蛋白質研究所 の共同利用・共同研究拠点活動として運営され、国際的に統一化された生体高分子の構造データベースを運営するとともに、解析ツールや関連データベースを提供しています。

例えば、 Nup214 を見て、多くのFGリピートを伴った長く形の定まらない領域があることに注目してみてください。 PDBにはヌクレオポリンの構造が多数登録されています。 PDBjで ヌクレオポリン のキーワードで検索すると見つけられるでしょう。

分子の司書 現代は分子生物学にとって、幸福な時代である。1944年、アベリー（Avery）による「DNAが遺伝物質である」というの発見により始まった知識の急増は、必然的にワトソン（Watson）とクリック（Crick）によるDNA分子構造モデルの提唱へとつながる。そして、遺伝暗号を解読するための詳細 ...

曲者検知の信号送信 細胞表面にある様々な受容体と同様に、Toll様受容体も2量体を形成して信号を細胞内に伝える。受容体は細胞膜をまたぎ細胞内外に渡って存在しており、細胞外には大きな馬蹄形部分を、細胞内には小さなリン酸化酵素ドメイン（kinase domain）を伴っている。リポ多 …

移動中の受容体 糖質コルチコイドは、 エストロゲン受容体 （estrogen receptor）とともに核内受容体の仲間（ファミリー）に属している。これは リガンド結合ドメイン （ligand-binding domain）、 DNA結合ドメイン （DNA-binding domain）、 トランス活性化ドメイン （transactivation domain）という3つの部分で ...

シトクロムcは細胞内に配線された電気回路に1つの接点を形成する。そして、細胞のエネルギー生産における最終段階で電子を運搬する。この電子は元々糖の分解を通じて得られたもので、最終的には酸素に付加されて水になる（これが、私たちが呼吸で取り入れた酸素の最終的な運命 …

1www: ngf in complex with domain 5 of the trka receptor

理解を深めるためのトピックス PDBjのサイトで アルテミス （Artemis）または ポリメラーゼμ （polymerase mu）を検索すると、NHEJに関係する酵素を見ることができます。 例えば …