
Xenopus Piwi proteins interact with a broad proportion of the …
2016年8月23日 · To determine Piwi target RNAs, we used ribonucleoprotein-immunoprecipitation (RIP) and cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) to identify thousands of transcripts associated with the Piwi proteins XIWI and XILI (Piwi-protein-associated transcripts, PATs) from early stage oocytes of X. laevis and X. tropicalis. Most PATs associate with ...
Mammalian piRNA target prediction using a hierarchical attention …
2025年2月11日 · We postulate that during cancer progression, the PIWI protein interacts with piRNA, thereby executing a crucial role in the targeted cleavage of specific mRNAs by the PIWI-piRNA complex. To investigate this hypothesis, we conducted the analysis of expression profiles of small RNA-seq, RNA-seq and HIWI-RIP-Seq in both wide-type SNU-1 cells and ...
PIWI-interacting RNA-36712 restrains breast cancer progression …
2019年1月12日 · The effects of piRNA-36,712 on the malignant phenotypes and chemosensitivity of breast cancer cells were detected in vitro and in vivo. MS2-RIP and reporter gene assays were conducted to identify the interaction and regulation among piRNA-36,712, miRNAs and SEPW1P.
A Translation-Activating Function of MIWI/piRNA during Mouse ...
To understand the mechanism for the PIWI/piRNA machinery to regulate spermiogenic mRNAs at post-transcriptional levels, we previously embarked on a systematic effort to identify mouse PIWI (MIWI)-associated mRNAs in mouse spermatids by RNA co-immunoprecipitation (RIP) in combination with UV crosslinking coupled with deep sequencing (CLIP-seq ...
PIWI 蛋白质相互作用,所以被命名为PIWI相互作 用RNA (PIWI-interacting RNA),简称piRNA[1-4]。 PIWI是一类生殖系细胞专一性蛋白。 与之前发现的miRNA/siRNA相比,piRNA有 以下不同之处:(1) 与不同的Argonaut家族蛋白质 相互作用。Argonaute家族蛋白质是小分子RNA介
piRNA:一类可能会火起来的非编码RNA - 知乎 - 知乎专栏
piRNA(PIWI-interacting RNA),是一种长25~33nt的非编码RNA,通过与PIWI蛋白相互作用而发挥作用,虽然同为非编码RNA,piRNA却远没有miRNA、LncRNA、circRNA知名度高,主要是因为piRNA主要在生殖系统中表达,相…
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piRNA通路中调控蛋白质研究进展
piRNA 是一类存在于动物生殖细胞中,长25~ 32 nt 的非编码小RNA ,能与PIWI家族蛋白结合形成piRNA 沉默复合物(piRNA-induced silencing complex, piRISC)来调控转座子和重复序列等基因组自私性遗传元件的活性,保证生殖系细胞基因组的稳定性和完整性[1]。 转座子是一类由基因组自身编码的可移动遗传因子,分为DNA 转座子和RNA介导的反转录转座子,可以通过移动或复制到新的位置影响基因组的信息和组织,导致基因组完整性的缺失[2], 熟的piRNA ,随后被加载到PIWI蛋白上 …
Nature | piRNA前体产生的机制 - 知乎 - 知乎专栏
PIWI相互作用RNA即piRNA,是2006年被发现的一类动物特有的小非编码RNA,长度约为24-31个碱基。不同于 microRNA 和 siRNA ,piRNA可以引导与之相互作用的 PIWI蛋白 靶向降解目的转录本,促进异染色质组装和DNA甲基化。此外,piRNA通路的结构使其既能对快速进化的病毒和转 ...
Nature | piRNA信号通路新调控因子 - 知乎 - 知乎专栏
近日,英国爱丁堡大学 Dónal O’Carroll 研究组发文题为 SPOCD1 is an essential executor of piRNA-directed de novo DNA methylation, 找到了MIWI2相互作用的新型因子SPOCD1并揭开了促进年轻的转座元件甲基化沉默的具体机制。 生殖细胞产生精子和卵子是生殖和遗传的重要基础。 维持生殖细胞完整性的其中一个巨大挑战是转座元件通过转座可能会造成基因突变。 在哺乳动物中,DNA甲基化是转座元件沉默的重要决定因素。 哺乳动物生殖细胞在发育早期阶段从体细胞 …
Piwi-interacting RNA在肿瘤中的研究进展 - 仁和软件
Piwi-interacting RNA (PiRNA), a newly identified class of small non-coding RNA whose length are 26-31nt, can combine with PIWI proteins to regulate transcription gene silencing process, heterochromatin modifications and maintain germline and stem cell function, etc..