2022年6月22日 · Our results indicate that the poly (A) capture full-length double-strand cDNA sequencing improves transcript quantification accuracy and the detection ability of alternative splicing events. It...

PolyA信号，也被称为聚腺苷酸化信号或 polyA尾，是真核基因3'末端普遍存在的信号序列。 其核心序列基序是 AAUAAA，其中AATAAA核心基序是最早被鉴定出来的polyA信号，对mRNA 3'末端的 多聚腺苷酸化 至关重要。 PolyA信号在mRNA的转录后修饰过程中发挥着核心作用。 在真核生物中，mRNA的转录终止和多聚腺苷酸化是同时进行的。 当转录机器行进到mRNA的3'末端并遇到PolyA信号时，会触发一系列的酶促反应。 这些反应包括mRNA 3'末端的切割、多聚腺苷酸聚 …

2020年6月16日 · Here we present a straight forward NGS-method for poly(A) profiling, which applies a direct 3’-end adaptor ligation and the template switching for 5’-end adaptor ligation for cDNA library construction. Poly(A) lengths are directly calculated from base call data using a self-developed pipeline pA-finder.

2023年4月15日 · Illumina RNA-Seq的原理是通过富集mRNA（polyA富集）或去除rRNA，产生片段化的RNA序列，然后将RNA逆转录生成双链cDNA，在片段末尾加入测序接头后进行PCR扩增。 cDNA分子聚集在流动池，通过DNA合成体系中的3’端封锁荧光标记的核苷酸底物读取荧光信号，从一端（单端测序）或两端（成对末端测序）进行测序。 常用的方法包括TAIL-Seq和PAL-Seq，借助于制备完整的包括polyA尾在内的3’端mRNA测序文库。 首先将RNA与生物素化的3’ …

我们的结果表明，poly(A) 捕获全长双链 cDNA 测序提高了转录本量化的准确性和选择性剪接事件的检测能力。 它还有望有助于确定 DNA 变体对剪接事件的重要性。

PAT法 [ PCR poly (A) test ] 可以快速、灵敏地从总 RNA 中分析特异 mRNA，而且可以定量估算 RNA poly (A) 尾长度。 这方法中，包括 cDNA 合成的整个操作过程都在一个反应管中完成，不仅操作更简便，也减少了可能存在的 RNase 污染。 尤其是 PAT cDNA 合成后非常稳定，并可重复使用，该方法的易操作性及灵敏度使其可以在任何系统中分析 poly (A) 尾的长度，目前已成功应用于鼠卵母细胞、果蝇卵母细胞和肝胎、线虫、酵母及培养细胞中 poly (A) 的分析。 1. PAT …

2022年6月22日 · Our results indicate that the poly (A) capture full-length double-strand cDNA sequencing improves transcript quantification accuracy and the detection ability of alternative splicing events. It is also expected to contribute to the determination of the significance of DNA variants to splicing events. © 2022. The Author (s).

2019年11月22日 · Here, we develop a method at single-cell level sensitivity that enables quantification of poly (A) tails along with the full-length cDNA while reading non-adenosine residues within poly (A)...

2025年3月18日 · A number of methods have already been developed for high-throughput analysis of poly(A) content and length based on PCR-amplified cDNA 2,9,10,11. Apart from PCR-based biases, these methods have ...

2010年1月1日 · Poly (A) PCR enables global mRNA amplification from picogram amounts of RNA and has been routinely used to analyse expression in small samples including single cells. The poly (A) cDNA pool generated is also indefinitely renewable and as …