
[Lammps] 经验之谈,如何解决:Out of range atoms - cannot compute PPPM
1 天前 · 楼主你好,lampps里长程力处理如pppm等,在盒子距离内的力,用potentials计算,超出盒子距离的力,采用傅立叶转化在倒空间中计算,在预平衡不计算长程力对结果有影响么?
lammps技巧:Out of range atoms - cannot compute PPPM原因分 …
本文介绍一个关于“pppm”的一个改错技巧。 在lammps力场设置中,如果pair类型带有“long”关键词,需要计算长程库仑力,如: lj/cut/coul/long 。 长程库仑力的计算需要特定算法, …
LAMMPS中kspace含义及报错原因 - 分子模拟 (Molecular …
2023年6月8日 · 当使用包含长程项的势函数设置(比如buck/coul/long)时,长程项在截止半径外在k空间内求解,需要用kspace_style指定求解器,pppm求解器需要ppp三项周期性边界条件;
在服务器中提交lammps计算时,用多少个核计算,才会使得自己和别人的运算会更快?是不是提交核数越多越快?如何提高运算速度(pppm …
2023年5月8日 · 建议计算长程经典作用力时候,采用该算法pppm,写法:kspace_style pppm 1.0e-4。该算法比ewald的要快很多倍(5倍以上,测试过),精度选择1.0e-4即可(自己选择)。
LAMMPS学习资源整理 - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计算化 …
2019年4月17日 · 也是困扰了很久问题,每次我进行建模计算的过程中,非常频繁的出现报错就是out of range atoms - cannot compute PPPM。 之前一直按照我师兄教我的办法去减小步长去进 …
LAMMPS常见错误解析-CSDN博客
2020年9月14日 · 本文介绍一个关于“PPPM”的一个改错技巧。 在lammps力场设置中,如果pair类型带有“long”关键词,需要计算长程库仑力,如:lj/cut/coul/long。 长程库仑力的计算需要特定 …
【LAMMPS学习】八、基础知识(2.8)长程色散设置 - CSDN博客
2024年4月15日 · 为了选择可提供快速、准确模拟的 pppm/disp 参数,有两种方法,它们都有各自的优点和缺点。 第一种方法是通过 kspace_modifyforce/disp/real 和 …
cannot compute PPPM原因分析及解决办法 - CSDN博客
2022年6月24日 · 本文介绍一个关于“PPPM”的一个改错技巧。 在lammps力场设置中,如果pair类型带有“long”关键词,需要计算长程库仑力,如:lj/cut/coul/long。 长程库仑力的计算需要特定 …
chap2: PME, SPME和PPPM - 知乎 - 知乎专栏
三种经典的算法-- PME, SPME 和 PPPPM --都有着相同的思路, 仅仅是在一些细节处理上不同. 基本步骤为: 力的分配: 在MD中, 从泊松方程计算出能量后, 需要计算每个电荷受到的力. 为了将 …
[Lammps] lammps运算报错Non-numeric pressure - 计算化学公社
2024年3月29日 · 可能是模型的问题吧,用soft势或者nve/limit之类的跑一下,还不行就缩小步长。 赞!