2024年8月31日 · NCBI's Gene Expression Omnibus (GEO) is a public archive and resource for gene expression data.

GEO (Gene Expression Omnibus) 是一个公共的功能基因组学数据库，最初是为了存储芯片数据，后期随着 NGS 的广泛应用纳入了各种平台的高通量组学数据。 很多文献都会将实验数据上传至 GEO，并在文献结尾处给出对应的 GSE ID 号，方便其他人下载数据进行研究。 下面我们来看一下如何在Linux上编写bash脚本下载GSE数据。 首先我们要知道GEO数据库上存放四种数据类型： GEO Series (GSE)：提供了有关整个实验的元数据和汇总数据。 GEO Samples (GSM)：表示 …

2024年2月18日 · GSM（Gene Expression Omnibus Sample）和GSE（Gene Expression Omnibus Series）是NCBI的Gene Expression Omnibus (GEO) 数据库中使用的两个重要术语，它们代表了数据库中存储的数据类型和组织方式。 GEO是一个公共数据库，用于存储 高通量基因表达数据 （如 微阵列 和 序列化数据），以及其他形式的 基因组数据。 GSE代表一系列相关的样本组成的数据集，这些样本通常是作为一个实验研究项目的一部分来收集和分析的。 每个GSE …

2024年7月11日 · 对于GEO平台上托管的很多GSE数据集而言，一般对于series_matrix.txt.gz文件太小，没有有效的表达数据情况，都会在该GSE数据集的网页下方有表达文件的下载链接，虽然文件名可能千奇百怪，各种各样，一般我们都可以手动下载这些文件后，对这些文件进行进一步的 ...

2020年10月6日 · Here, we show that in lung cancer, interaction between paxillin (PXN) and integrin b4 (ITGB4), components of the focal adhesion (FA) complex, contributes to cisplatin resistance. Knocking down PXN and ITGB4 attenuated cell growth and improved cisplatin sensitivity, both in 2D and 3D cultures.

2024年7月13日 · gse数据集包括了原始的基因表达数据和相关的实验描述信息，可以被科研人员用于分析和挖掘基因表达的模式和变化。 具体而言，GSE数据集通常包含以下内容：

Dual-luciferase, RNA pull-down and RIP assays demonstrated that lncRNA XIST up-regulated the PXN expression by competitively binding to miR-132. Moreover, silencing of lncRNA XIST and up-regulation of miR-132 could suppress tumor formation ability, cell proliferation and migration, but enhanced apoptosis in gastric cancer.

Lexus IS F 2UR-GSE AMAZING V8 SOUND! - Assetto Corsa | PXN V10 Gameplay=====__My PC Specifications__🔴Processor: Intel i5-96...

2019年5月15日 · Through inducing exon 4 inclusion, MBNL3 upregulates PXN expression, which mediates the pro-tumorigenic roles of MBNL3. Collectively, these data demonstrate detailed mechanistic links between oncofetal splicing factor, splicing event, and tumorigenesis, and establish splicing factors and splicing events would be potential therapeutic targets.