
硬核汇总:RIP、RNA-pull-down和FISH实验原理与应用!
2020年8月15日 · ①RIP技术 (RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。 ②利用抗体特异性结合目的蛋白的特征,将细胞内蛋白质-RNA 复合物沉淀下来,对蛋白-RNA复合物中的RNA 进行检测的方法。 ③RNA-免疫共沉淀. 利用抗体专一性特征,检测蛋白质-RNA相互作用。 ①RIP-qPCR 研究细胞在有或无RA处理时 SIRT6蛋白上结合的lncRNA 。 IgG或SIRT6 …
RIP实验技术 - 王进的个人网站
2020年10月26日 · rip可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀chip技术的类似应用,但由于研究对象是rna-蛋白复合物而不是dna-蛋白复合物,rip实验的优化条件与chip实验不太相同(如复合物不需要固定,rip反应体系中的试剂和抗体绝对不能含有rna酶,抗体需经rip实验验证等等)
GAPDH as a model non-canonical AU-rich RNA binding protein
2019年2月1日 · GAPDH was found to act as a positive posttranscriptional regulator of CSF-1 and SCN3A (GAPDH binding increases mRNA stability), and as a negative posttranscriptional regulator of ET-1, Cox-2, and SCN1A (GAPDH binding decreases mRNA stability).
RNA 免疫沉淀 (RIP) 实验方案 - Abcam中文官网
rip抗体技术用于定位体内的rna-蛋白质相互作用, 从而调控mrna和非编码rna的功能。本实验方案将rna结合蛋白进行免疫沉淀, 鉴定结合转录rna 而通过检测。
RIP实验全攻略二:解锁RNA与蛋白互作网络__伯信生物
2024年9月5日 · rip实验结果可与其他转录组学、蛋白质组学或表观遗传学数据相结合,综合分析rna与蛋白的相互作用及其在基因表达调控中的作用机制。 例如,结合RNA pulldown实验与RIP实验相互佐证;结合ChIP-Seq和ChIRP-Seq数据可以揭示RNA与DNA结合蛋白的共定位情况;结合RNA-Seq数据 ...
RNA-蛋白互作|一文读懂RIP、RNA pull-down和MeRIP - 知乎
RIP、 RNA pull-down 和MeRIP等实验技术是我们深入研究RNA和蛋白质相互作用的关键工具。 RIP用于选择性地富集与特定RNA相互作用的蛋白质,RNA pull-down通过RNA探针捕获相互作用蛋白质,而MeRIP则用于甲基化RNA的研究。 下面就让我们详细了解一下—— RIP,全称为 RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RNA 结合蛋白免疫沉淀,其主要目的是富集RNA分子和与之相互作用的蛋白质,以便进一步分析这些相互作用的性质和功能。 ① 交联: 首先, …
Enhancer transcription profiling reveals an enhancer RNA-driven ...
2025年3月14日 · U1 serves as a nuclear marker, and GAPDH serves as a cytoplasmic marker, indicating higher nuclear concentration of LTFe. ... In the RNA immunoprecipitation (RIP) assay, we used anti-HNRNPF and ...
【RIP解读】一种研究RNA与蛋白质的相互作用的实验方法 - 知乎
RIP是指 RNA Binding Protein Immunoprecipitation ,同 RNA pulldown 相似,也是一种研究RNA和蛋白相互作用的方法,但与RNA pulldown的出发点不同, RIP是从蛋白出发研究蛋白RNA相互作用的技术。就是已知一个蛋白,把与蛋白结合的RNA富集出来并鉴定,以证实蛋白 …
GAPDH为何可以做qPCR内参 - 知乎 - 知乎专栏
GAPDH 或G3PDH是 甘油醛-3-磷酸脱氢酶 ( glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase )的英文缩写。GAPDH是 糖酵解 反应中的一个酶,广泛分布于各种组织中的 细胞 。 该酶广泛存在于众多生物体中,并且在细胞中含量丰富,占总蛋白的10%-20%。
Peli1, regulated by m6A modification, suppresses NLRP3 ... - Nature
3 天之前 · GAPDH was used as the reference gene. The data was analyzed with the 2 −ΔΔCT method. The primers were listed as follows (5’-3’): ... RIP assay was conducted using a RIP kit (Millipore ...