
rrnDB - the Ribosomal RNA Operon Copy Number Database
The rrnDB is a curated database that catalogs the numbers of genes that encode for 16S and 23S ribosomal RNAs in Bacteria and Archaea.
什么是16S rRNA,rDNA, 菌群研究为什么用16S测序,细菌如何 …
16S rRNA是一种 细菌 和 古细菌 中常见的 核糖体RNA 分子。 它在细胞中起着重要的功能,包括 参与蛋白质合成的核糖体组装 和 识别启动子序列 的功能。 由于16S rRNA在细菌和古细菌中具有 高度保守的序列区域和变异的序列区域,因此它被广泛用于 细菌分类 和 进化研究中。 相比之下, 16S rDNA这个术语并不常用。 rDNA是指 编码核糖体RNA的DNA序列,因此16S rDNA可以理解为指代 编码 16S rRNA的DNA序列。 •科研中通常使用16S rRNA. 在科研文献和学术讨论中, 通 …
核糖体RNA - 百度百科
核糖体RNA,即rRNA,是细胞内含量最多的一类 RNA,也是3类RNA(tRNA, mRNA,rRNA)中 相对分子质量 最大的一类RNA,它与 蛋白质 结合而形成 核糖体,其功能是在mRNA的指导下将 氨基酸 合成为 肽链 [1] (肽链在内质网、高尔基体作用下盘曲折叠加工修饰成蛋白质, 原核生物 在细胞质内完成)。 rRNA占RNA总量的82%左右。 rRNA单独存在时不执行其功能,它与多种蛋白质结合成核糖体,作为蛋白质生物合成的“装配机”。 rRNA的分子量较大, …
16S rRNA测序解读:16S rRNA和16S rDNA的区别
2024年2月21日 · 16S rRNA(16S ribosomal RNA)是一种核糖体RNA,存在于细菌和古细菌等微生物细胞中。 它是核糖体的组成部分之一,具有特定的序列和结构。 16S rRNA在细胞内充当核糖体的一部分,参与蛋白质合成的过程。 16S rRNA测序是一种分子生物学技术,用于分析微生物群落中不同微生物的存在和多样性。 这项技术之所以如此重要,具有以下几个方面的用途和意义: 1. 微生物鉴定和分类: 微生物世界中存在着大量的微生物种类,有些是致病菌,而有些是有益 …
mRNA、tRNA、rRNA在蛋白质合成中的作用 - 知乎 - 知乎专栏
在生物体内发现主要有三种不同的RNA分子在基因的表达过程中起重要的作用。 它们是 信使RNA (messengerRNA,mRNA)、 转移RNA (tranfer RNA,tRNA)、 核糖体RNA (ribosomal RNA,rRNA)。 RNA含有四种基本碱基,即 腺嘌呤 、 鸟嘌呤 、 胞嘧啶 和 尿嘧啶。 此外还有几十种 稀有碱基。 RNA的一级结构主要是由AMP、GMP、CMP和UMP四种 核糖核苷酸 通过3',5'磷酸二酯键相连而成的多聚核苷酸链。 天然RNA的二级结构,一般并不像DNA那样都是 …
Ribosomal DNA - Wikipedia
The ribosomal DNA (abbreviated rDNA) consists of a group of ribosomal RNA encoding genes and related regulatory elements, and is widespread in similar configuration in all domains of life.
什么是16S rRNA,rDNA, 菌群研究为什么用16S测序,细菌如何 …
2023年9月16日 · 16S rRNA是一种 细菌 和 古细菌 中常见的 核糖体RNA分子。 它在细胞中起着重要的功能,包括 参与蛋白质合成的核糖体组装 和 识别启动子序列 的功能。 由于16S rRNA在细菌和古细菌中具有 高度保守的序列区域和变异的序列区域,因此它被广泛用于 细菌分类 和 进化研究中。 相比之下, 16S rDNA这个术语并不常用。 rDNA是指 编码核糖体RNA的DNA序列,因此16S rDNA可以理解为指代 编码 16S rRNA的DNA序列。 •科研中通常使用16S rRNA. 在科研文献 …
干货:一文读懂mRNA rRNA tRNA结构和功能 - 知乎 - 知乎专栏
2024年3月25日 · 核糖体 RNA (rRNA) 构成了核糖体的很大一部分;读取和解码 mRNA。 转移 RNA (tRNA) 将 氨基酸 运送到核糖体,在那里它们结合形成蛋白质。 某些 RNA 能够催化化学反应,例如切割和连接其他 RNA 分子,以及催化核糖体中肽键的形成;这些被称为 核酶。 RNA结构是怎么样的? RNA或核糖核酸是核苷酸的聚合物,由核糖、磷酸盐和诸如腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和尿嘧啶等碱基组成。 它是一种聚合分子,在基因的编码、解码、调节和表达中具有各种生物 …
核糖体DNA - 百度百科
核糖体 DNA(Ribosomal DNA,rDNA)是一种 DNA序列,该序列用于 rRNA 编码。 核糖体是 蛋白质 和r RNA 分子的组合,翻译mRNA分子以产生蛋白质的组件。 真核生物 的rDNA包括一个单元段,一个 操纵子,以及由NTS、ETS、18S、 ITS1 、5.8S、ITS2和28S束组成的 串联重复序列。 rDNA还有另一个基因,由SrRNA基因编码,位于大多数真核生物的 基因组 中。 S rDNA序列也存在于 果蝇 的串联重复序列。 在大型的rDNA序列,rDNA的 重复单元 之间的 多态性 非常低, …
NAR:rrnDB-16S拷贝数校正数据库 - CSDN博客
2018年11月24日 · rrnDB 数据库,全称ribosomal RNA operons (rrn) DataBase,是一个收集了NCBI全基因组数据的细菌和古菌的16S拷贝数的数据库。 可以通过NCBI或RDP数据库的ID进行检索(Search)和评估(Estimate)。 16S基因在一个物种中会有多拷贝以维持生存安全,在进行高通量测序时,因为拷贝数基数不同,PCR后测序会放大这种基数效应,造成物种的reads数产生偏差。 rrnDB数据库就是基于物种全基因组的拷贝数进行评估和矫正的一款在线数据库和工具。 …