
基于重测序数据计算 XP-EHH 选择信号 - 简书
2024年2月2日 · 首先,对于每个群体,软件计算每个基因位点上的单倍型延伸性(extended haplotype homozygosity,EHH)。 然后,计算交叉种族延伸随机游走(cross-population extended haplotype homozygosity,XP-EHH),即两个群体之间每个基因位点的EHH比率。
基于单体型haplotypes的群体选择信号的检测——EHH & iHS - 简书
2021年1月20日 · 检测haplotype的选择信号最好利用定相phased后的数据集。 方法有EHH和CLR法。 这里利用R包中的 rehh 包进行分析。 rehh 有强大的说明和教程文档,后续深入了解其原理时值得进一步学习研究。 rehh tutorial rehh的实践 读取数据。 分别读取两个群体 …
生信小白成长记——如何使用rehh包计算群体间XP-EHH - 知乎
本期我们来聊一聊使用rehh包检测选择信号的另一种方法,计算群体间 XP-EHH (cross-population EHH)。 如果上一期大家有练习的话那么这一节将会轻松很多。 话不多说,直奔主题。 XP-EHH的定义. 输入文件. 使用rehh包计算XP-EHH的输入文件格式和计算iHS的输入文件格式是一样的。 但是区别是因为使用XP-EHH方法检测的是群体间的选择信号,所以输入文件不是一个 haplotype data file 和一个 SNP. information data file,二是两个haplotype data file和两个 information …
rehh包的使用 - 简书
2021年3月16日 · res中包含的输出是一个包含四个元素的列表: mrk.name:焦点标记的名称/标识符。 freq:包含焦点标记所有等位基因频率的向量。 ehh:一个数据框,其中包含焦点标记的每个等位基因的EHH值。 将参数 ihh:每个等位基因均具有iHH的向量,即EHH值定义的EHH曲线上的 …
分子群体遗传(十二)-- 利用连锁不平衡识别自然选择 - 知乎
2018年9月9日 · 最常用的方法就是通过单倍体纯合子(haplotype homozygosity)来识别受选择的突变位点。 下面就介绍最常见的 EHH 、 iHH 、 iHS 等概念。 extended haplotype homozygosity (EHH),首先是有一个核心位点,其有两个等位基因,一个是祖系基因,一个是突变基因。
SN8GB标准和sN12、5有什么区别_百度问一问 - Baidu
2022年12月2日 · 亲SN8GB标准和sN12、5的区别如下:sn12.5表示12.5个sn,sn8表示8个sn。 双壁波纹管国标壁厚一般来说在6毫米左右。 双壁波纹管主要以聚氯乙烯为原料,内壁更加光滑,具有外形美观、抗压力好,抗老化等优势。 双壁波纹管国标寿命可达20年以上,是地埋通信电缆和电力电缆保护用的常用的排污管道。 等级划分为SN2、SN4、SN8、SN12.5等,代表每平方米所承受的压力。 辨别双壁波纹管质量的好坏的方法如下:1、在购买波纹管的时候,先观察波纹 …
使用Hapbin基于EHH、iHS、XP-EHH方法检测基因组中的选择信号 …
EHH (Extended Haplotype Homozygosity)、 iHS (Integrated Haplotype Score) 和 XP-EHH (Cross Population Extended Haplotype Homozogysity)是常用的基于 haplotype 分析基因组受选择情况的方法。 其中,EHH 和 iHS 是检测一个群体中的选择信号,而 XP-EHH 是在两个群体中进 …
ZQSn12-2出自哪个标准 - 百度知道
ZQ Sn12-2作为一种新型的锡青铜材料, 现已被广泛应用于减速传动机械的轮缘制作, 本文结合近十年在生产实际中对ZQ Sn12-2合金的熔炼, 离心铸造工艺的探索, 制定出已为生产实践证明是比较成功的ZQ Sn12-2合金的离心铸造工艺。
SN12-04DNA-上海克特传感器科技有限公司,圆柱型接近开关,接近 …
2024年9月27日 · SN12 商品特色: 具有直流三线;两线以及沟通两线全类型; 沟通具有脉冲吸收功能;防护等级:IP67(IEC)
pe管环刚度是多少 - 百度知道
2024年10月22日 · 常见的PE管环刚度等级有SN8、SN10、SN12.5和SN16等。 其中,SN代表环刚度单位,数值越大表示管道的抗变形能力越强。 * 不同等级的PE管适用于不同的应用场景。 例如,高压输水或燃气输送通常要求更高的环刚度。 3. 影响环刚度的因素: * PE管的环刚度不仅与管道的材料有关,还与其结构设计、制造工艺以及使用环境条件密切相关。 * 在实际工程中,选择适当的PE管环刚度等级是确保管道安全、经济、高效运行的关键。 综上所述,PE管的环刚度 …
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