The SCOP database, created by manual inspection and abetted by a battery of automated methods, aims to provide a detailed and comprehensive description of the structural and evolutionary relationships between all proteins whose structure is known.

2024年9月21日 · SCOP（Structural Classification of Proteins）是一个基于蛋白质三维结构的手工分类系统，由研究者通过分析蛋白质结构的相似性和进化关系手动构建。 家族（Family）：基于高序列相似性，将具有相似结构和功能的蛋白质放在一起。 超家族（Superfamily）：即使序列相似性较低，但仍然推测具有共同进化起源的蛋白质结构会被归类为同一超家族。 结构域（Domain）：SCOP中的基本分类单元，代表蛋白质结构中能够独立折叠且具有功能的部分 …

2022年3月3日 · SCOP2的主页上也有搜索条，可以查看某一个PDB结构的结构分类。 图1搜索结果中的第2到第5条，就是该蛋白质结构的四层分类。 第一层Class，第二层Fold，第三层Superfamily，第四层Family。 第一层Class之上是SCOP数据库的根。

2020年4月24日 · Pfam 数据库 是一个蛋白质结构域家族的集合，包括了一万六千多个蛋白质家族。 蛋白质一般是由一个或多个功能区域组成，这些功能区域通常称作结构域（domain）。 在不同的蛋白质中结构域以不同的组合出现，形成了蛋白质的多样性。 识别出蛋白质中的结构域对于了解蛋白质的功能有重要意义。 比如 Toll 样受体蛋白：人的免疫系统中有许多种 Toll 样受体蛋白，所有这些种类的 Toll 样受体蛋白都可以分成三个结构域， 每个结构域行使不同的功能。 胞外域 …

SCOPe (Structural Classification of Proteins — extended) is a database developed at the Berkeley Lab and UC Berkeley to extend the development and maintenance of SCOP. SCOP was conceived at the MRC Laboratory of Molecular Biology, and developed in collaboration with researchers in Berkeley.

2024年6月25日 · The SCOP2 browser allows users to type in a protein name in the search box and select from the options in the autocomplete list. Alternatively, you can enter a SCOP2 unique identifier (SCOP ID) to find structure (s) of interest. Since there are two ways of classifying a protein - the protein name

The Structural Classification of Proteins (SCOP) database is a largely manual classification of protein structural domains based on similarities of their structures and amino acid sequences. A motivation for this classification is to determine the evolutionary relationship between proteins.

2020年11月7日 · The SCOP database, created by manual inspection and abetted by a battery of automated methods, aims to provide a detailed and comprehensive description of the structural and evolutionary relationships between all proteins whose structure is known.

The SCOP database, created by manual inspection and abetted by a battery of automated methods, aims to provide a detailed and comprehensive description of the structural and evolutionary relationships between all proteins whose structure is known.

蛋白质结构分类（SCOP）数据库是根据蛋白质域的进化和结构关系组织的蛋白质域分类。 我们报告了为增加结构性数据的覆盖范围而进行的一项重大努力，旨在为PDB中的代表提供几乎所有领域超家族的分类。