
High Resolution Radial Distribution Function of Pure Amorphous …
1999年4月26日 · Calculation of the first neighbor shell coordination ( ) as a function of maximum indicates that measurement of out to at least is required to reliably determine the radial distribution function (RDF). A change in and subtle changes in the rest of the RDF were observed upon annealing, consistent with point defect removal.
径向分布函数如何分析? - 知乎
计算这一种类型原子(硅)的径向分布,统计出任意两个这一种类型原子的距离,使用OVITO软件输出的距离的分布如下RDF数据图。 常见的晶态结构中每个原子的位置都是固定,是有序的结构,其径向分布函数具有长程的峰,而对于非晶结构,其径向分布函数一般只有短程的峰。 在case 1体系中,原子都在平衡位置波动做热运动,偏离于原始位置,导致峰值降低,宽度变大,从而出现了峰的形状。 当体系升温,原子热运动剧烈,远离平衡位置,其峰的高度变小,宽度变宽 …
谈谈RDF - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计算化学公社
2022年5月18日 · RDF(radial distribution function)径向分布函数(或称对相关函数),其含义是 每个球层位置的被计算组的原子的数密度与其平均数密度的比值,描述密度如何因距离参考粒 …
【转载】径向分布函数(RDF)计算:从原理到实践-CSDN博客
2024年4月8日 · 本文将先介绍RDF的计算原理,再以一段分子动力学轨迹为例,展示如何通过MDtraj计算RDF,并通过RDF计算配位数。 已对RDF熟悉的读者,可跳过第一部分。
基于MS的水分子径向分布函数 (RDF)计算 - 知乎
选择xtd轨迹文件,点击Modules,Forcite,Analysis,选择Radial distribution function,Sets中分别选择O和H,计算O和H之间的RDF。 其中 Cutoff小于盒子最小边长的1/2。 总结: 首先建立分子的模型,其次构建AC盒子,重点需要设置好分子的计算模块,选择合适的力场模型。 然后分别进行结构优化,动力学分析。 最后选定模块中分析中的RDF功能,计算可得到RDF计算结果就是分子间H-H、H-O、O-O的径向分布函数。
关于径向分布函数不同峰位置对应的作用力? - 分子模拟 …
2015年5月29日 · 较近距离有明显的rdf的峰,可以说有较强、相对稳定的吸引相互作用,虽然不一定是氢键,但是氢键相对属于强一些的分子间相互作用,是可以导致峰的出现的。 至于5~7埃的峰,怎么去解释还是得看实际情况。 范德华作用毕竟很弱,而且随距离衰减很快,一般的模拟温度下这样距离的范德华吸引产生的峰往往都很不明显了。 若峰很鲜明,没准是其它什么原因导致的。 建议从体系结构、相互作用特征入手,并且结合其它方式判断,比如考察某些原子间距离分布 …
【LAMMPS系列】径向分布函数RDF与结构因子SF - 哔哩哔哩
pair RDF是设定两种类型原子,然后统计出任意两个这两种类型原子的距离,结果是这个距离的分布;而simple RDF就是给一个点或者一个原子,算围绕这个点的其他原子的分布。
The Atomic Arrangements and Radial Distribution Functions of …
Experimental scattering measurements of the radial distribution function (RDF), g (R), of amorphous silicon 1,2 and amorphous germanium, 1,3 plotted in Fig. 1, show that these substances preserve the local tetrahedral structure of their crystalline forms with peaks representing four first-neighbors at R O and twelve second neighbors at (8/3) 1/ ...
【LAMMPS系列】径向分布函数RDF与结构因子SF - 简书
pair RDF是设定两种类型原子,然后统计出任意两个这两种类型原子的距离,结果是这个距离的分布;而simple RDF就是给一个点或者一个原子,算围绕这个点的其他原子的分布。
【LAMMPS系列】径向分布函数RDF与结构因子SF - CSDN博客
2022年1月4日 · 本文介绍了如何使用PYTHON计算SiO2的偏径向分布函数(partial RDF)和结构因子,探讨了RDF在材料非晶化过程中的应用,并解释了为何计算出的partial RDF不趋向于1。