
从Tn5结构来看如何利用Tn5进行文库构建 - 知乎 - 知乎专栏
研究者发现,体外Tn5实验,只需要核心序列(ME:CTGTCTCTTATACACATCT)、Tn5转座酶以及Mg2+就能够行使Tn5 ”剪切-复制”功能。 因而利用这种原理,科学家们将含测序接头序列一致的序列添加到 ME序列 中,在转座酶“剪切-复制”时,将ME序列插入靶DNA序列的同时,加上测序序列,从而在后续建库扩增过程中,实现一步法PCR建库就能获得完整的用于测序的文库。 图2.含不同测序引物的tn5酶应用场景 [2] 当然,Tn5酶虽然有这么强的优势,但是也有一定的缺陷, …
Tn5丨转座现象如何应用于文库构建 - 知乎 - 知乎专栏
Tn5-DNA Lib Prep kit for Illumina/MGI 是针对纯化的DNA样品进行快速文库构建的试剂盒。 其原理是采用转座酶对DNA进行片段化并同时加上部分接头序列。 与传统的DNA文库构建方法相比,降低了模板量的需求,减少了对打断仪器的依赖,且显著缩短了文库构建时间。
Tn5转座酶与高通量测序文库构建-CSDN博客
2022年4月12日 · 一、Tn5建库原理. 研究发现,Tn5转座酶可以仅识别OE序列在DNA中随机插入序列,完成体外的转座。根据这一原理,将测序的read1和read2加入OE序列中,Tnp识别并剪切含有OE序列的read1和read2序列后便可形成Tn5转座复合体。
从Tn5结构来看如何利用Tn5进行文库构建 - 翌圣生物
研究者发现,体外Tn5实验,只需要核心序列(ME:CTGTCTCTTATACACATCT)、Tn5转座酶以及Mg2+就能够行使Tn5 ”剪切-复制”功能。 因而利用这种原理,科学家们将含测序接头序列一致的序列添加到ME序列中,在转座酶“剪切-复制”时,将ME序列插入靶DNA序列的同时,加上测序序列,从而在后续建库扩增过程中,实现一步法PCR建库就能获得完整的用于测序的文库。 图2.含不同测序引物的tn5酶应用场景 [2] 当然,Tn5酶虽然有这么强的优势,但是也有一定的缺陷,就 …
“Tn5”转座原理和应用 - 知乎 - 知乎专栏
Tn5是分子生物学中常用的转座子,其序列包含四个重要组分: IS50R上面的Tnp和Inh分别编码转座酶 (Tnp)和转座抑制因子 (Inh),Inh可与Tnp形成多聚体复合物进而抑制Tnp介导的转座; IS50L上面的P3和P4分别编码Tnp和Inh的无功能形式。 OE序列由19bp的碱基组成,可被Tnp所识别,参与整个Tn5的转座。 IE序列不参与Tn5的转座 (OE-OE),仅参与IS50的转座 (IE-OE)。 Tn5上的抗生素基因主要有kan、str和bleo。 1、转座开始时,两个Tnp识别结合Tn5转座子两端的OE序 …
Tn5 Transposase Tn5转座酶(10 U/μL) - 翌圣生物
Tn5转座酶识别其转座子序列的内端(inside end, IE)、外端(outside end, OE)和嵌合端(mosaic end, ME)序列。 利用其转座原理,能携带核酸打断并连接入底物核酸序列中,形成打断和插入机制,广泛应用于体外转基因以及转座酶法建库中。
碧云天生物技术-BeyoNGS Tn5 Transposase (BeyoNGS Tn5转座酶) …
碧云天生产的BeyoNGS™ Tn5 Transposase,中文名为BeyoNGS™ Tn5转座酶,是一种来源于 E.coli 、经过改造具有极高活性的Tn5转座酶突变体,可以高效地将Tn5转座子(Transposon)随机插入到目标序列,对于真核和原核生物的DNA都有极高的转座插入效率。本产品可以特异性识别 ...
[酶] ta不行!NGS文库构建中的明星-Tn5酶 - VAZYME
该技术利用Tn5酶将DNA序列插入到开放的染色质区域,以检测全基因组范围内的染色质开放程度,并获取蛋白质可能的结合位点,进而筛选感兴趣的调控因子。 目前,ATAC-seq广泛应用于核小体定位、早期胚胎发育研究以及肿瘤机制研究等领域。 图3. ATAC-seq原理图. 4. CUT&Tag是一种研究蛋白质-DNA相互作用的新方法,Protein A/G与包埋了接头的Tn5融合作为CUT&Tag核心酶发挥作用(图4)。 Protein A/G-Tn5在抗体引导下靶向目的蛋白,并在目的位点周围进行DNA片 …
Tn5 Transposase Applied in Genomics Research - PMC
Tn5 is a compound transposon. Tn5 transposons were discovered in Escherichia cdi and consist of a core sequence encoding three antibiotics (neomycin, bleomycin, and streptomycin) and two inverted IS50 sequences, IS50L and IS50R, which encode a Tn5 transposase (Tnp) (Figure 1 …
搞懂illumina nextera Tn5 和ATAC seq adaptor 序列 - 简书
2017年10月26日 · 在准备NGS文库的时候,会有用到转座酶Tn5,Nextera DNA Library Preparation Kit ,比如ATAC-seq就有用到这个Tn5。转座酶携带有特定的序列称为转座子Transposon。 下面是ATAC-seq的工作原理,想必听说过ATAC-seq的,对这个图都会再熟悉不过了。 Tn5是kit里面带有的,没什么大不同。