
TSO(Template switch oligo)是什么 - 知乎 - 知乎专栏
该策略依赖于 莫洛尼鼠白血病病毒 (MMLV) 逆转录酶的内在特性和使用独特的 模板转换寡核苷酸 (TS oligo,或 TSO)。 TSO全称Template switch oligo 模板转换寡核苷酸,是一种寡核苷酸,在反转录的过程中由逆转录酶加在非模板链5端的C寡核苷酸,用于下游的cDNA扩增。 在第一链合成过程中,当到达 RNA 模板的 5' 末端时,MMLV 逆转录酶的末端转移酶活性会在新合成的 cDNA 链的 3' 末端添加一些额外的核苷酸(主要是脱氧胞苷)。 这些碱基充当模板转换 (TS) 寡核苷酸锚定 …
模板末端转换机制(Switching Mechanism At the end of RNA …
逆转录酶(依赖RNA的DNA聚合酶):① MMLV:莫洛尼白血病病毒中分离 ② 禽成髓细胞增生病毒 中分离. 传统的反转录体系:Buffer、dNTP、RNase inhibitor、Reverse Transcriptase、Oligo dT(主要针对真核生物mRNA的 Poly A尾)or Random Primer(主要针对无PolyA的mRNA 以原核生物为代表)or Gene-Specific Primer (主要针对已知部分序列的mRNA) RACE技术 (Rapid Amplification of cDNA Ends)-cDNA末端的快速扩增:一种基于PCR技术从样本中快速扩 …
关于SMART-seq2建库过程中template switching(模板转换)的反应机制的理解 …
2019年11月8日 · 简单来说,SMART技术主要利用了一种逆转录酶(Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase,莫罗尼小鼠白血病病毒逆转录酶MMLV-RT)的两个特性: 1、首先这种逆转录酶在合成到Cdna的3’端,也就是对应的Mrna的5’端的时候会随机的引入几个不依赖于模板的碱基,多数情况下是三个胞嘧啶,有点像是画蛇添足地样子,但是却给科学家们带来了便利。 利用这个特点,我们可以通过设计一种template switching oligo(TSO)帮助逆转录酶完成模板 …
Template switching of reverse transcriptase - NEB
Single-cell RNA-Seq (scRNA-Seq) has led to an unprecedented understanding of gene expression and regulation in individual cells. Many scRNA-Seq approaches rely upon the template switching property of Moloney murine leukemia virus (MMLV)-type reverse transcriptases.
Efficient N-tailing of blunt DNA ends by Moloney murine ... - Nature
2017年2月2日 · In the presence of a single-stranded DNA often called template-switching oligonucleotide (TSO), which contains a stretch of ribonucleotide Gs at its 3′ end, MMLV-RT switches template from RNA...
单细胞smart-seq2建库原理 - 简书
2019年12月15日 · oligo-dTVN经过退火结合到mRNA的poly(A),逆转录酶MMLV开始进行逆转录。 oligo-dTVN 的3'末端含有 VN ,其中 N 为A/T/C/G任何碱基, V 为A/C/G。 这样的设计能够使 oligo-dTVN 能够锚定到poly(A)+RNA的3′-UTR末端,从而在逆转录时避免poly(A)尾的逆转录。
TSO(Template switch oligo)是什么 - 百度知道
2024年4月10日 · smart技术利用mmlv逆转录酶的特性,结合tso的巧妙设计,使得即使是单细胞rna样本也能生成完整的cdna库。tso在转录链的反转录过程中,逆转录酶会将一个c寡核苷酸加到非模板链的末端,随后在5'端的转换过程中,形成一个碱基锚定位点。 tso工作原理详解
Non-templated addition and template switching by Moloney …
2019年11月29日 · Single-cell RNA-Seq (scRNA-Seq) has led to an unprecedented understanding of gene expression and regulation in individual cells. Many scRNA-Seq approaches rely upon the template switching property of Moloney murine leukemia …
单细胞转录组建库原理:SMART、TargetAmp和10X genomics
2021年5月16日 · 由于使用了特殊活性反转录酶(Moloney Murine Leukemia Virus , MMLV,莫洛尼鼠白血病病毒反转录酶)进行反转录,所以在它转录到mRNA的5'末端的时候,会在cDNA链3'端加上几个不依赖于模版的C碱基。
单细胞测序系列之三:单细胞转录组测序 - 知乎专栏
TSO引导MMLV逆转录酶发生模板转换,使其继续逆转录TSO序列获得双链cDNA。 加入PCR引物进行PCR预扩增; 利用Tn5转座酶对DNA进行打断的同时将接头添加到cDNA的两端,再进行最后一次PCR扩增后,即可上机测序。 相比较于Smart-seq,Smart-seq2的主要技术优化点包括 :
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