Tpex：耗竭前体T细胞分化|CD8|Tex|耗竭|细胞|淋巴结|肿瘤|-健康界
接受抗原刺激后初始T细胞（Tnaive）会分化成为记忆T细胞（Tmem）和效应T细胞（Teff），Tmem是对Teff功能储存的形式，拥有再次分化为Teff的潜力。 而Tmem的形成需要经过记忆前体T细胞（Tmp）形式，Tmp的形成可能包括两个途径，分别是由Tnaive直接分化和由Teff分化而来。 而活跃的慢性感染和肿瘤中，持续的抗原暴露会破坏这一循环。 Tnaive未能分化为拥有强大增殖能力的Tmp，而是成为耗竭前体T细胞（Tpex），导致T细胞反应崩溃，最终成为耗 …
Temporal single-cell tracing reveals clonal revival and ... - Nature
Dec 23, 2021 · We observed increased levels of precursor exhausted T (Texp) cells in responsive tumors after treatment, characterized by low expression of coinhibitory molecules and high expression of GZMK.
《自然·癌症》：北大学者一文讲透PD-1抑制剂治疗中T细胞的变化
Jan 19, 2022 · 但许多的临床研究发现，患者对免疫治疗的应答程度与耗竭T细胞前体（Texp）有关，这是一类抑制性受体低表达的细胞。 因此有研究认为，既然 Texp不太可能是终末Tex逆转而来，那么其主要来源就是外周血中新近浸润的T细胞 [7]。 但是 Texp如何对PD-1抑制剂产生反应仍然没有得到解释，以往关于肺癌的研究受限于bulk-seq技术，没有很好的探究免疫检查点阻断产生的免疫反应的细胞基础，而一些利用了单细胞技术的研究则专注于探究未经治疗的肿瘤样本。 …
10X单细胞分析揭示了肺癌抗 PD-1 治疗过程中前体耗竭 T 细胞的 …
观察到治疗后反应性肿瘤中前体耗尽 T (Texp) 细胞的水平增加，其特征是共抑制分子的低表达和 GZMK 的高表达。 相比之下，无反应的肿瘤未能积累 Texp 细胞。 数据表明，Texp 细胞不太可能来自终末耗竭细胞的重振；相反，它们是通过 (1) 局部扩张和 (2) 外周 T 细胞补充的新的和预先存在的克隆型而积累的，这里将这种现象称为克隆复兴。 研究提供了对基于 PD-1 疗法的潜在机制的见解，暗示 Texp 细胞的克隆复苏和扩增是改善 NSCLC 治疗的步骤。 免疫检查点阻断 (ICB) …
顶刊精读 | 张泽民院士团队最新文章，时空单细胞解析免疫疗法反 …
Aug 14, 2024 · 具体来说，耗竭型T细胞（Tex）或肿瘤反应样CD8+ T细胞（Ttr-like）与治疗效果密切相关，而Tex细胞在PD-1封锁后与其他多种肿瘤富集的细胞类型显示出相关比例变化。 此外，我们揭示了肿瘤中血液相关的Ttr-like细胞较少耗竭的表型，并发现它们较高的丰度预示着更好的治疗结果。 最后，基线时循环CD8+ T细胞中较高水平的主要组织相容性复合体（MHC）II相关特征与较好的反应相关联。 我们的研究为理解新辅助PD-1封锁后CRC中时空细胞动力学提供了 …
时间动态的单细胞追溯显示出耗竭T细胞前体在肺癌的抗PD-1治疗 …
本文共采用了来自36位非小细胞肺癌患者的共47例肿瘤样本，研究 抗PD-1 和化疗治疗对T细胞特性的影响。 涵盖了从未治疗的（naïve）、治疗后有应答、及治疗后无应答的样本。 以耗竭T细胞及其前体为重点，研究了其在治疗过程中的表达程度、克隆表型、克隆规模及分布的变化。 结果表明，耗竭T细胞前体可能是通过局部扩张或外周T细胞的补充和预先存在的克隆型的累积而来的，该现象在这里称为克隆复兴。 （1）在CD4+T细胞中，与应答患者相比，对治疗无应答的患者 …
TeXP is a pipeline to gauge the autonomous transcription level of …
TeXP is a pipeline to gauge the autonomous transcription level of L1 subfamilies using short read RNA-seq data - gersteinlab/texp
Nature Cancer | 时序单细胞追踪揭示抗PD-1免疫治疗在肺癌中的作 …
Jan 8, 2022 · 观察到治疗后反应性肿瘤中前体衰竭T（Texp）细胞的水平增加，其特点是共抑制分子的低表达和 GZMK 的高表达。 相比之下，无反应的肿瘤未能积累Texp细胞。
001-单细胞时序性追踪探究肺癌中PD-1疗法对耗竭T细胞的效应
Jun 5, 2022 · 免疫检查点抑制剂通过阻滞T细胞的共抑制信号，并且介导了肿瘤免疫中显著的模式转换； 但在实际中，免疫检查点抑制剂只在一小部分肺癌患者中起效，因此，现有的免疫疗法仍然需要进一步升级； 之前的研究中，已经报道了PD-1能够逆转处于耗竭状态的Texp细胞；
TeXP: Deconvolving the effects of pervasive and autonomous ...
Aug 19, 2019 · TeXP builds mappability signatures from LINE-1 subfamilies to deconvolve the effect of pervasive transcription from autonomous LINE-1 activity. In particular, it apportions the multiple reads aligned to the many LINE-1 instances in the genome into these two categories.