2024年4月24日 · Here we report that a thermophilic archaeal TnpB enables efficient gene editing in the natural host. Interestingly, the TnpB has different TAM requirements for eliciting cell death and for...

研究人员发现实现TnpB的DNA切割功能需要同时满足两个条件：（1）TAM序列；（2）与靶基因匹配的位于reRNA 3’端的序列。 随后，作者对切割产物进行了测序分析，结果显示，TnpB采取的是一种交错切割模式，在NTS（non-target strand）的多个位置和 TS (target strand) 的单个 ...

2023年6月29日 · Further characterization of these 25 TnpBs enables prediction of the transposon-associated motif (TAM) and the right-end element RNA (reRNA) directly from genomic sequences. We established a...

2021年10月7日 · Here we show that TnpB of Deinococcus radiodurans ISDra2 is an RNA-directed nuclease that is guided by an RNA, derived from the right-end element of a transposon, to cleave DNA next to the...

通过体外DNA切割实验，研究者发现IscB具备由ωRNA引导识别 (图2左)并切割特定DNA双链序列的能力，其PAM序列也被作者称为TAM (target-adjacent motif)。 不同于spCas9的是，IscB的切口是粘性末端 (图2右)。 由于IscB具有RuvC和HNH两个酶活性位点，研究者也通过点突变实验验证了IscB的nickase能力，突变其中任何一个酶活性位点都能产生相应的DNA单链切割能力 (图3)。 衡量核酸酶作为基因编辑工具最重要的指标是其在真核细胞内切割DNA的能力，所以研究者在文章 …

2024年4月25日 · tnpb能够识别广泛的tam变体序列并介导基因编辑，包括众多不引起细胞死亡的tam。 重要的是，TnpB对弱TAM处的靶点表现出极高的靶向特异性，利用此特性，成功实现了基于TnpB的同源重组驱动的高效单核苷酸编辑。

通过系统表征 tam 变体，我们揭示了 tnpb 识别广泛的 tam 序列进行基因编辑，包括那些不会引起明显细胞死亡的序列。 重要的是，TnpB 对侧翼较弱的 TAM 的靶标显示出非常高的靶向特异性。

2023年7月4日 · 研究表明，在TnpB系统中，与RNA介导的编辑器相关的三大要素（核酸酶、gRNA骨架和TAM序列）均可通过生物信息分析准确预测，这为大规模筛选高活性TnpB核酸酶奠定了基础。

2023年7月2日 · 该结果表明在 TnpB 系统中，RNA 介导的编辑器相关的三大要素 —— 核酸酶、gRNA 骨架和 TAM 序列（分别相当于 CRISPR-Cas 系统的 Cas9 蛋白、gRNA和PAM），均可通过生物信息分析准确预测，为大规模筛选高活性 TnpB 核酸酶奠定了基础。

2021年9月9日 · In vitro plasmid cleavage assays for multiple TnpB proteins from this cluster using a reprogrammed guide demonstrated RNA-guided cleavage with a 5′ TAM (Fig. 5N and fig. S36). We recombinantly purified a TnpB from Alicyclobacillus macrosporangiidus (AmaTnpB) and confirmed its reprogrammable RNA-guided dsDNA endonuclease activity ( Fig. 5O and ...