2022年4月24日 · VMD（Variational mode decomposition）是一种自适应、完全非递归的模态变分和信号处理的方法。 该技术具有可以确定模态分解个数的优点，其自适应性表现在根据实际情况确定所给序列的模态分解个数，随后的搜索和求解过程中可以自适应地匹配每种模态的最佳中心频率和有限带宽，并且可以实现固有模态分量（IMF）的有效分离、信号的频域划分、进而得到给定信号的有效分解成分，最终获得变分问题的最优解。 它克服了EMD方法存在端点效应和模态分 …

2018年1月25日 · 我用Tachyon渲染器进行渲染 在VMD目录下确实得到了一个vmdscene.dat 同时还有一个分辨率并 ... 你好。 这个问题怎么解决，能教教我吗？

2019年8月19日 · 如果是只显示某个区域的格点数据的等值面，VMD没法直接实现。需要通过Multiwfn对格点数据进行屏蔽（参考Multiwfn手册4.13.4节里的例子）之后导出格点数据再在VMD里看，或者在Chimera里显示等值面的时候把不想要的地方擦除。

2023年9月11日 · vmd（变分模态分解）是一种全新的信号分解方法，可以将信号分解成多个模态分量，每个模态分量代表着信号中不同的振动模式。总之，vmd分解是一种非常实用的信号分解方法

vmd是专门为建模、可视化和分析生物大分子(如蛋白质、核酸等)。 可读取 PDB文件 并显示，并提供多种分析、可视化选择、渲染方法，还可以对 分子动力学 （MD）模拟的轨迹进行处理和分析。

2024年6月5日 · 本文记录将GROMACS生成的规矩文件导入VMD显示的具体操作步骤。参考链接为： 如何用VMD保存和查看gromacs的模拟轨迹 - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计算化学公社 (keinsci.com) 1. 准备好GROMACS模拟生成的gro文件和轨迹文件(.xtc)，如下图所示。 2. 打开VMD程序，首先加载.gro ...

在主窗口（VMD main）中点击FILE -> New Molecule. 然后点击Browse 找到需要打开的PDB文件，再点击Load，就可以载入蛋白。 在VMD Display 窗口中，我们可以看到肌红蛋白，如下图所示： 默认是以lines的形式显示的蛋白。

VMD是一款免费的分子结构和模拟可视化软件，在处理大型数据时，如模拟轨迹，相比其他软件（例如PyMol）更为轻便高效。 尽管在图形用户界面方面可能不如其他软件丰富，但VMD在生物医学研究领域有着广泛的应用前景。

+我领取：https://t.1yb.co/K7eT VMD是一款非常小而精致的可视化工具，也是业界非常常用且功能强大的分子动力学可视化软件。 本期讲解了VMD轨迹查看与动画制作 ，Follow me(期待每天和你一起进步！

2024年3月19日 · 在VMD模式下安装操作系统后，测试结果为：VMD模式在总体上性能优于无驱动模式，且基本完胜Solidigm驱动；而无驱动模式的表现总体上弱于Solidigm驱动。