2022年2月17日 · Today, AWS for Genomics announces the addition of miniWDL as a workflow engine in Amazon Genomics CLI, an open source tool that makes it easier to run genomics workflows at-scale by automating the deployment of workflow engines and compute clusters.

Extends miniwdl to run workflows on AWS Batch and EFS. This miniwdl plugin enables it to execute WDL tasks as AWS Batch jobs. It uses EFS for work-in-progress file I/O, optionally uploading final workflow outputs to S3.

2021年10月13日 · This post presents a new solution for deploying WDL workflows on AWS combining miniwdl with the Genomics Workflows Core (GWFCore). miniwdl is a lightweight WDL runtime, developed by the Chan Zuckerberg Initiative, focused on productivity for command-line interface (CLI) operators and workflow developers.

2024年2月4日 · miniwdl AWS plugin. Extends miniwdl to run workflows on AWS Batch and EFS. This miniwdl plugin enables it to execute WDL tasks as AWS Batch jobs. It uses EFS for work-in-progress file I/O, optionally uploading final workflow outputs to S3.

2022年12月4日 · Amazon Omics 允许您在 AWS 上执行生物信息学工作流，例如变体调用或基因表达、分析。这些计算工作负载使用工作流描述语言（WDL）和 Nextflow 等工作流语言定义，这些语言是特定领域的语言，用于指定多个计算任务及其输入和输出依赖关系。

The miniwdl runner schedules WDL tasks in parallel up to the CPUs & memory available on the local host; so a more-powerful host enables larger workloads. Separately-maintained projects can distribute tasks to cloud & HPC backends with a shared filesystem: AWS: miniwdl-omics-run tool for the Amazon Omics workflow service; AWS Batch plugin (DIY ...

2022年12月13日 · 亚马逊弹性计算云（Amazon EC2）在亚马逊Web服务（AWS）云中提供可扩展的计算能力。 使用AmazonEC2无需在硬件上进行前期投资，因此您可以更快地开发和部署应用程序。 您可以使用AmazonEC2根据需要启动任意数量的虚拟服务器，配置安全性和网络，并管理存储。 Amazon Simple Storage Service (Amazon S3)是一种对象存储服务，提供业界领先的可伸缩性、数据可用性、安全性和性能。 各种规模和行业的客户都可以使用 Amazon S3存储和保 …

2020年1月6日 · 由生信工程师编写wdl或cwl格式的基因分析工作流脚本，作为Cromwell的输入，通过API调用（或图形管理界面）的方式提交任务，分析过程中可通过AWS Batch服务的控制面板和CloudWatch-Log记录可以查看任务的执行状态，分析的结果保存在Amazon S3存储上。

2020年10月12日 · Miniwdl is a WDL interpreter and runtime (workflow runner). Like all foundational software, miniwdl started with a deep, informed focus on developer productivity: it emphasizes speed of execution, usable interfaces and abstractions, and good error messages that support the developer when something goes wrong.

该工作流描述语言（wdl）是指定数据处理与人类可读且可写的工作流的语法的方式。wdl使定义复杂的分析任务，在工作流中将它们链接在一起并使其执行并行化变得很简单。该语言使常见的模式易于表达，同时也允许不常见或复杂的行为。