WDL学习笔记 | 生物信息文件夹
2021年5月19日 · WDL基本元件有5个，分别是定义总流程的workflow、定义单个任务的task、运行任务的call、定义任务中命令的command以及输出output。 下面将以bwa比对流程为例，展 …
GitHub - openwdl/wdl: Specification for the Workflow Description ...
The Workflow Description Language (WDL) (pronounced as /hwɪdl/ or "whittle" with a 'd') is an open standard for describing data processing workflows using a human-readable/writeable …
WDL教程-基本概念篇 - 知乎 - 知乎专栏
对应WDL的结构，变量也分为两层，task层和workflow层。 最基本的变量有两个，一种是File，对应文件，一种是String对应的是字符。 task层的变量可以引用workflow层的变量，也可以直接 …
[每周一更]-(第112期)：WDL（Workflow Description Language） …
2024年8月30日 · WDL 是 Workflow Description Language的缩写，有时也写作 Workflow Definition Language，是美国 Broad Institute 推出的工作流描述语言。WDL + Cromwell（an …
wdl教程中文版 - 知乎 - 知乎专栏
2025年1月28日 · 教程内容较长，原始 md文件有需要的，公众号后台回复"wdl教程"获取，下面为部分截图。 首发于 小夜的生信笔记 切换模式
WDL脚本实战（一）-工作流、程序体、语法检查、输入输出及运 …
2021年11月28日 · WDL是由Broad Institute开发的一种生物信息流程开发语言，与传统的shell流程相比，具有复用性好、支持多种集群架构、便于多任务并行等优势，初次接触，写了个简易流 …
生物信息分析流程（2） - 沈文龙的博客 | Wenlong Shen's Blog
2018年9月15日 · The Workflow Description Language (WDL) makes it straightforward to define analysis tasks, chain them together in workflows, and parallelize their execution. 对于不同性质 …
WDL 流程语言编写及进阶（标准结构/线性输入输出/默认参数设 …
2022年5月17日 · WDL + Cromwell（an execution engine that can run WDL scripts）是目前可以更好使用GATK的一套工具。这里学习wdl的快速入门教程。WDL是一种流程编写语言，没有 …
利用WDL语言书写数据处理流程 - 简书
2021年5月6日 · The Workflow Description Language (WDL) is a way to specify data processing workflows with a human-readable and -writeable syntax. WDL makes it straightforward to …
GATK官方推荐的workflow语言-WDL - 简书
WDL是一种流程管理语言，语法简单，内置的支持并行等特征，适合编写pipeline。 运行 wdl 脚本只需两步，第一步编辑参数列表对应的 json 文件，第二步直接运行即可。