
WDL.Type — miniwdl documentation
A parametric type like ``Array[String]`` is represented by ``WDL.Type.Array(WDL.Type.String())``. Any kind of array satisfies ``isinstance(t,WDL.Type.Array)``, and ``WDL.Type.Array(WDL.Type.String()) == WDL.Type.Array(WDL.Type.String())``, but for example ``WDL.Type.Array(WDL.Type.String()) != WDL.Type.Array(WDL.Type.Float())``.
WDL教程-基本概念篇 - 知乎
WDL是 Broad Institute 开发的“human readable and writable”定义组织任务与工作流的一种语言。 从开发者及开发者赋予的名字中,我们就能看出WDL是一个面向生物信息/基因组学领域的专业的工具。
【WDL】3. 变量类型 - 简书
WDL的变量不同于一般语言变量,应该叫“占位符”——一旦赋值之后,不能在后续运行中变化 “先声明,再使用”,变量类型有严格规定,主要体现在String和File
wdl教程中文版 - 知乎专栏
2025年1月28日 · 之前翻译的一版 wdl 中文教程。 教程内容较长,原始 md 文件有需要的,公众号后台回复"wdl教程"获取,下面为部分截图。 除夕之夜,祝大家新年快乐。 之前翻译的一版wdl中文教程。 教程内容较长,原始 md文件有需要的,公众号后台回复"wdl教程"获取,下面为部分截图。
GitHub - dnanexus/wdlTools: WDL tools for parsing, type …
Scala programming language library for parsing WDL, and command-line tools for type-checking, code formatting, and more. The wdlTools.syntax package implements an abstract syntax tree …
GitHub - openwdl/wdl: Specification for the Workflow Description ...
The Workflow Description Language (WDL) (pronounced as /hwɪdl/ or "whittle" with a 'd') is an open standard for describing data processing workflows using a human-readable/writeable syntax.
WDL脚本实战(一)-工作流、程序体、语法检查、输入输出及运 …
2021年11月28日 · WDL是由Broad Institute开发的一种生物信息流程开发语言,与传统的shell流程相比,具有复用性好、支持多种集群架构、便于多任务并行等优势,初次接触,写了个简易流程试水。
Structs | Workflow Description Language (WDL) Documentation
Structs (spec link) represent custom types that you can define an pass around within WDL. Structs are comprised of member fields that have a name and an associated type.
WDL 流程语言编写及进阶(标准结构/线性输入输出/默认参数设 …
2022年5月17日 · WDL 定义了一个可执行的流程,它由call调用的一系列task组成,task 是一个模块化的一系列命令,可以复用,由call 语句调用在 workflow block里面。 task本身定义在外围,它可以import,建议这么书写,增加可保护性。 task调用顺序及书写顺序不决定流程执行task的顺序,但是建议顺序书写。 task层的变量可以引用workflow层的变量,也可以直接传参。 WDL结构中,变量分为两层,task层和workflow层,最基本的变量有两个,一种是File,对应文件,一种 …
wdl脚本实战 - CSDN博客
2024年2月7日 · 本文详细介绍了WDL脚本的工作原理,包括工作流的结构、任务输入和输出的设置,以及如何通过JSON文件传递参数。 还讨论了Cromwell的使用、命令语法、字符串拼接和WOMTool的验证工具。