
2P-Seq - Enseqlopedia
2017年6月20日 · Poly (A)-tail-primed sequencing (2P-Seq) is designed to quantify mRNA stability and translational efficiency by characterizing 3’UTR isoforms (Spies et al., 2013). First, poly …
Modified from Noah Spies’s protocol for poly(A)-primed sequencing (2P-seq). Rädle B, Rutkowski AJ, Ruzsics Z, Friedel CC, Koszinowski UH, Dölken L. Metabolic labeling of newly transcribed …
PolyASite - Exploring 3' end processing
Learn more about the techniques used for 3' end sequencing. In the 2P-Seq protocol, reverse transcription is accomplished by an anchored oligo (dT) primer. The products of reverse …
各种RNAseq原理 - 青蛙快飞 - 博客园
2019年4月19日 · RNA Sequencing Methods Low-Level RNA Detection CEL-Seq CirSeq CLaP CytoSeq Digital RNA Sequencing DP-Seq Drop-Seq Hi-SCL InDrop MARS-Seq Nuc-Seq PAIR
Widespread Influence of 3′-End Structures on ... - ScienceDirect
2017年5月18日 · The DIM-2P-seq mutation frequencies, which represent intracellular DMS accessibility of A and C residues, are plotted in the bar graph and color coded on the predicted …
- [PDF]
2p-seq protocol
The 2P-Seq-RPI1, RPI2, etc primers are standard issue Illumina reverse PCR primers, designed for use with the standard Illumina barcode system. 2P-Seq-PE1.1 is a custom primer used …
2P-Seq - Illumina
在Illumina,我们的目标是应用创新技术来分析遗传变异和功能,实现几年前甚至还无法想象的研究。 我们的任务是提供创新、灵活、可扩展的解决方案以满足客户的需求。 作为一家重视合作 …
RNA-seq转录组数据分析丨一套完整的案例流程 - 简书
2022年12月11日 · 今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程,适用于初学者入门阅读,从原始测序数据开始,经过质控、序列比对、定量表达、差异表达、功能富集等一系列分析步骤, …
2P-seq - bio-protocol.org
2P-Seq protocol for 3' end tag sequencingNoah Spies, updated Mar 8, 2012 Overviewpoly (A) selection, followed by precipitationRNase T1 digest, precipitateReverse transcription, gel …
学术||党云琨课题组eLife发文揭示密码子偏好性成因
2018年4月3日 · 为在基因组水平了解转录终止信号与密码子偏好性的关系,研究人员利用2P-seq测定了粗糙脉胞菌全基因的转录终止状况。 发现绝大多数转录都终止于3’UTR,但仍有很多发生 …