2020年5月14日 · 例：PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O3 - H3 . 警告原因：O3上的氢未和氢键受体形成氢键。 解决策略 ：找到一个合适的氢键受体原子，并把H3限制在O3和氢键受体之间，否则需要给出合理解释。

最近，某高校一位同学求助，数据其他都已处理好，但有一个B级警报PLAT420（参阅推文“ CheckCIF-PLAT420 ”）尝试了很久也无法解决，如 图1 所示。 H6B是与金属配位的水分子O6上的氢原子，O6周围环境如 图2 所示。

按照推文“ 晶体结构解析案例36 (B级警报PLAT420) ”中相同的思路，O31椭球有点形变，于是对其做二组分无序处理，加氢后精修至收敛，发现第二组分中H31D没有合适的 氢键 受体，仍然触发B级警报PLAT420，如 图3 所示。 尝试调整第二组分水分子氢原子朝向，精修至收敛后，两个组分的氢原子朝向又变了，此时由H31B触发B级警报PLAT420，如 图4 所示。 于是删除氢原子，重新加氢，然后立即用AFIX 3固定氢原子，精修后，用“HTAB 3.5”指令生成氢键，此时氢原子位置 …

最近，南京某高校友友的一个警惕数据遇到B级警报PLAT420（参阅推文“ CheckCIF-PLAT420 ”），如 图1 所示。 查看O8周围环境（参阅视频“Olex2基操-查看原子周围环境 (B级警报PLAT417-氢原子距离过近)： bilibili.com/video/BV1y ”），如 图2 所示，金属上配位的水O8，其中H8A和O4i形成 氢键，而O8周围能够作为H8B的氢键受体的最近的原子为O5ii，相距3.479 Å。 观察到O8椭球有点形变拉长，因此考虑对其做 二组分无序处理，这样其中一个组分氧原子和O5ii的 …

O4上的氢没有氢键的受体，你氢键有点问题，仔细检查下结构。 有个空洞，你看看是不是有原子没指认，如果都正确就说明下就行了。 或者用platon计算下空洞的体积也ok。 PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O4 - H4A ... Please Check. O4上的氢没有氢键的受体，你氢键有点问题，仔细检查下结构。 PLAT601_ALERT_2_B Structure Contains Solvent Accessible ... O4上的氢没有氢键的受体，可是我不管怎么加氢都有这个问题问题。 我也 …

420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O3 - H3. 警告原因：O3上的氢未和氢键受体形成氢键。 解决方法：找到一个合适的氢键受体原子，并把H3限制在O3和氢键受体之间，否则需要给出合理解释。 430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O2 .. O31 2.78 Ang. 432_ALERT_2_G Short Inter X...Y Contact O68 ..

PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O22 -- H22B ... Please Check 截图这一部分是一个一维结构，，穿插在另一个配体形成的三维结构中穿插的结构（第二张图）。

你首先看一下有没有合适的Q峰投成溶剂分子，如果残余Q峰比较小或者比较乱，则再考虑用platon里的squeez处理。 然后将产生的.sqz 文件里面的数据复制到.cif文件的最后面即可！ 你首先看一下有没有合适的Q峰投成溶剂分子，如果残余Q峰比较小或者比较乱，则再考虑用platon里的squeez处理。 然后将产生的.sqz 文件里面的数据复制到.cif文件的最后面即可！ 用platon处理之后将sqz里面的内容复制到cif文件里面，这样是能消除这个错误还是说明有残余峰不能指认不 …

PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O15 --H15A . Please Check PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O19 --H19B . Please Check 这两个位置理论加氢加不上可以使用傅里叶加氢 PLAT417_ALERT_2_B Short ... 应用了傅里叶加氢，也还有这个问题 PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O19 --H19B . Please Check 这应该 ...

PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O1 - H15 ... 这个问题说明 O1 没有形成氢键。 通常情况下，一个稳定的结构模型，含有氢原子的客体分. 子通常会与附近的氧或者氮原子形成氢键。 解决的办法是需要调整 O1 上的氢原子键长和方. 向（键角），使得 O1（假如是水分子）上的 2 个氢原子能够形成稳定氢键。 PLAT052_ALERT_1_B Info on Absorption Correction Method Missing ... 你需要多轮精修，一般 10 轮左右精修，把 Maximum Shift 数值精修到趋近于 0。