科研 | Nature子刊：预测抗生素抗性基因在细菌基因组中的传播|Nature|细菌基因组|ARGs|MGEs…
2021年10月24日 · 利用MGEs的遗传标记，如转座酶、整合酶和其他重组酶，作者在ARGs的邻近遗传区域确定了可能的MGEs。 作者排除了质粒和噬菌体基因，这些基因可能参与质粒或噬菌 …
Global biogeography and projection of soil antibiotic ... - Science
2022年11月16日 · Here, 1088 metagenomics samples are applied to profile soil antibiotic resistome (fig. S1A and table S1) and mobile gene elements (MGEs). We identify microbes …
又双叒叕！五大数据库全方位注释，抗性宏基因组分析项目再次升 …
SARG （the structured ARG reference database）数据库，其由ARDB和CARD整合而成，目前更新到v2.3版本，是已知的最为完整的抗生素抗性基因数据库，根据不同基因抵抗抗生素的类型 …
Forecasting the dissemination of antibiotic resistance genes across ...
2021年4月23日 · Antibiotic resistance spreads among bacteria through horizontal transfer of antibiotic resistance genes (ARGs). Here, we set out to determine predictive features of ARG …
bioone/ARGs-MGEs-MAP: This is the source code for ARGs-MGEs-MAP - GitHub
The antibiotic resistance genes (ARGs) database is derived from ARGs-OAP (v2.2), [CARD 2022 (v3.25) ] (https://card.mcmaster.ca/), and [DeepARG] (https://github.com/gaarangoa/deeparg). …
可移动基因元件(mobile genetic elements,MGEs) - 大漠胡天 - 博 …
2020年5月21日 · 可移动基因元件(MobileGenetic Element，MGES)是指包括病毒、质粒和转座子在内，如质粒、噬菌体、整合和结合元件，可促进微生物的进化。 可移动基因元件( mobile …
ARGs宏基因组分析工具总结 - 知乎 - 知乎专栏
特点：可同时分析 ARGs及其他功能基因（MGEs, MRG）, 物种注释. 数据库：ARGminer/DeepARG、NanoARG-MGE database、BacMet、Functional Genes …
科研文献|通过宏基因组组装和装箱方法解读抗生素选择压力下抗生 …
2020年11月1日 · ARGs 通常位于移动遗传元件 (MGEs) 上，例如质粒、整合和结合元件 (ICE)、 转座子 和整合子，它们是能够在 DNA 分子内部或之间移动并在细菌细胞之间转移（Partridge …
.污水处理系统中ARGs、MGEs分布特征与菌群结构相关性研究
菌群结构的变化会影响ARGs的分布,对菌群结构与ARGs之间的相关性进行CCA分析,结果显示tetE和tetM显著地影响城市生活污水处理系统中细菌在属水平的分布(P0.05)。
Interactions and evolutionary relationships among bacterial mobile ...
4 天之前 · For instance, large conjugative plasmids often harbour insertion sequences, transposons, the latter often also carrying integrons with ARGs 88. As one of the simplest …
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