2024年11月12日 · Here, we employed microcosm studies to investigate the effects of microplastic diversity on soil ARG dynamics through metagenomic analysis. Additionally, we evaluated the associated potential...

2020年1月1日 · Here, we developed a novel approach integrating metagenomic analysis and flow cytometry to identify and quantify potential pathogenic antibiotic resistant bacteria (PARB; carrying both antibiotic resistance genes (ARGs) and virulence factor genes (VFGs)) in the environment, which are of particular concern due to their infection ability and antib...

2023年12月27日 · 本研究量化了毒力因子基因（VFGs）在塑料际及其周围环境（水和土壤）中的丰度，以更好地评估致病风险。研究结果表明，VFGs在塑料际中具有选择性富集，这归因于特定微生物群落的聚集。在毒力和致病性方面，这项研究…

2022年4月10日 · In this study, we provide a comprehensive characterization of ARGs for 52,515 microbial genomes covering various Earth's ecosystems, and conduct the risk assessment for ARG-carrying species based on further identification of mobile genetic elements (MGEs) and virulence factor genes (VFGs).

2022年2月1日 · Antimicrobial resistance genes (ARGs) and virulence factor genes (VFGs) constitute a serious threat to public health, and climate change has been predicted to affect the increase in bacterial pathogens harboring ARGs and VFGs.

工具“Pipeline for Plasmid annotation”侧重于质粒序列的详细功能基因注释，能够精确快速地识别 ARGs、VFGs、MRGs、ISs、oriT 和其他质粒特征。 用户可以通过上传 FASTA 格式文件轻松进行质粒序列识别和分析。 工具“BLAST-plasmids”允许用户将其序列与 PIPdb 数据库中的质粒序列进行比对。 图2 PIPdb的页面. 基于PIPdb，研究组进行了一系列病原菌所携带的质粒的汇总分析。 与其他生境相比，与“人类”相关的PSCs在病原菌属中分布更为广泛，且每个基因组携带 …

2022年2月1日 · In this study, we investigated the characteristics and distribution of ARGs, VFGs, and PARB in the Alaskan soil cores using a metagenomic approach. We identified ARGs, VFGs, and both types of genes in PARB that naturally exist in the Arctic permafrost region.

主要关注点： 结合对微生物风险重要的两个因子—— 抗生素耐药基因 （ARG）和毒力因子基因（VFG）；致病性抗生素耐药细菌（PARB）的快速识别（培养耗时）与分析. 1. ARG 和 VFG 对人为活动的响应. 2. 基于携带 ARG 和 VFG 的 MAG. Identification and quantification of bacterial genomes carrying antibiotic resistance genes and virulence factor genes for aquatic microbiological risk assessment Water Research，Liang，2020 主要作…

2024年6月24日 · 该研究为探究生态系统中抗生素和重（类）金属共抗性微生物提供了新的研究思路，并证实了农业土壤微生物组中ARGs和MRGs共存于同一遗传原件，且具备更强的可迁移性和致病性潜力，提出应关注农业土壤有机肥施用带来的潜在生态健康风险。 图3.机器学习流程及农田土壤ARG-MRG共抗性微生物丰度的全球分布图. 研究于2024年6月17日在Nature...

本研究量化了毒力因子基因（VFGs）在塑料际及其周围环境（水和土壤）中的丰度，以更好地评估致病风险。 研究结果表明，VFGs在塑料际中具有选择性富集，这归因于特定微生物群落的聚集。 在毒力和致病性方面，这项研究为评估塑料际中与病原体相关的风险提供了新的见解。 作者： Lu Wang等. 期刊：Journal of Hazardous Materials. 时间： 2023-12-27. 影响因子： 13.6. 组学： 16S rDNA、高通量qPCR芯片（毒力因子基因芯片VFG Chip） DOI： …