This brief guide gives an overview of all the important bits of the WDL language to ensure you become an expert in writing your own tasks and workflows. Before diving into an example, let's take a closer look at the major concepts within the language.

2021年5月19日 · WDL基本元件有5个，分别是定义总流程的workflow、定义单个任务的task、运行任务的call、定义任务中命令的command以及输出output。 下面将以bwa比对流程为例，展示WDL的语法。 WDL支持以“#”作为注释，另外为了格式规范，建议使用四个空格作为缩进。 首先在WDL脚本中，需要声明WDL的版本，这里写version 1.0声明为WDL 1.0。 除此之外，WDL还有draft1，draft2等版本（version 1.0即draft3）。 我没有去研究过不同版本间的差异，目前1.0 …

The Workflow Description Language (WDL) (pronounced as /hwɪdl/ or "whittle" with a 'd') is an open standard for describing data processing workflows using a human-readable/writeable syntax.

Guides and reference materials for the Workflow Description Language (WDL). Designed to be written and understood by software engineers, domain experts, and platform operators. …

基本的WDL包括五个重要的概念：workflow, task, call, command and output.理解了就可以完成在本地运行的基本的脚本。 除此之外，还有 runtime、parameter_meta、meta等概念，它们可以给流程增加更多的特性，这里我们后面再介绍，先从基本概念开始。 workflow层的三个概念

2021年4月7日 · WDL全称Workflow Description Language，由大名鼎鼎的Broad Institute开发，目前只有1.0版本。 可能是因为实用性的原因吧，现在WDL中的功能添加或维护主要基于用户反馈，用户可以提交自己写的修改代码，会被汇总进“RFC Process”中。

2023年3月24日 · WDL ( workflow description language 工作流描述语言) 是Broadinstitute推出的一种，用于描述流程的编程语言。 与一般通用编程语言（C、Python、R、Perl等）不同，WDL语言开发的目标是为了更好的进行在集群环境下进行任务调度

2024年8月30日 · WDL（Workflow Description Language）是一种用于定义 数据处理 工作流的语言，旨在帮助研究人员和开发人员描述和执行复杂的数据处理任务。 WDL主要用于生物信息学领域，但也适用于其他需要定义多步骤数据处理的领域。 WDL的设计目的是简单、易读、可扩展，并与各种执行引擎兼容，如Cromwell和MiniWDL。 WDL脚本的基本结构包括以下部分： 任务（Task）：定义单个步骤的具体操作，包括输入、输出和命令。 工作流（Workflow）：定义 …

2021年3月23日 · 初步认识WDL，是 Workflow Description Language 的缩写，有时也写作 Workflow Definition Language ，是美国 Broad Institute 推出的工作流描述语言。 它很好的规范了目前串写流程的弊端，使得写出来的pipeline比较规范而且易于看懂。 此外它适合很多平台，移植性高，能出来大规模投递任务。 但是弊端就是不够灵活和中文学习资料很少。 对WDL语言进行解析是 Cromwell, 用java撰写的一个jar，它可以投递和监控任务，说白了它是把撰写好的WDL描 …

2022年4月11日 · 引言 工作流描述语言（Workflow Description Language），简称WDL，是一门开源的、标准化的以及人类可读写的用于描述任务和工作流的编程语言。 WDL设计的初衷是作为一种通用的工作流程语言，但它在生物信息学领域应用最为广泛。