
cBioPortal for Cancer Genomics
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生物信息学数据库使用教程(十):cBioPortal数据库使用教程 - 知乎
cBioPortal这个网站,促进多维度癌症基因集数据的探索,可以允许跨基因,样本和数据类型的可视化分析。 用户可以可视化一个癌症研究中多样本间基因改变的模式,并比较点多癌症研究中基因改变频率,或者在一个个体肿瘤样本中总结概括所有的相关的基因组改变。 这个网站也支持生物通路探索,生存分析,基因改变间的相互独特性分析,可选择性的数据下载,编程接口和可以用于发表的可视化总结。 整合进cBioPortal的基因组数据类型包括体细胞突变,DNA copy-number …
肿瘤生信挖掘必备数据库:cBioPortal数据库使用指南 - 知乎
cBioPortal数据库是一个包含TCGA和 ICGC 等大型的肿瘤研究项目,并整合癌症基因数据和临床数据的国际公共数据库,其整合的基因组数据类型包括 体细胞突变 、 DNA 拷贝数改变 (CNA)、 mRNA 和 microRNA (miRNA) 表达、 DNA 甲基化 、 蛋白质丰度 和 磷蛋白丰度。 cBioPortal可以进行多种分析,但最主要的还是与突变相关的各种分析及其可视化,其不仅支持单基因单癌症的查询,而且可以进行多基因单癌症、单基因多癌症、多基因多癌症,甚至是跨癌症基因组项目的 …
cBioPortal for Cancer Genomics
The table below lists the number of available samples per cancer study and data type. It also provides links to download the data for each study. For alternative ways of downloading, see …
TCGA数据挖掘终结者:cBioPortal - 知乎 - 知乎专栏
2019年1月24日 · cBioPortal(cbioportal.org/)由 Memorial Sloan Kettering Cancer Center (MSK)开发,是基于 TCGA 数据库开发的一款集数据挖掘、数据整合及可视化等多功能于一体的综合性开放网络平台。 开发者将该网站发表在 Cancer Discovery(IF:24.3)上面,后来由于用的人太多,作者又把网站的说明书拿出来发了一篇 Science Signaling(IF:6.4),真好玩+任性。 由此可见,cBioPortal 是经过专业杂志认可的数据分析工具,其可信度是相当高的。 下面直接带领 …
cBioPortal/cbioportal: cBioPortal for Cancer Genomics - GitHub
The cBioPortal for Cancer Genomics provides visualization, analysis, and download of large-scale cancer genomics data sets. For a short intro on cBioPortal, see these introductory slides. If you would like to know how to setup a private instance of the portal and/or get set up for developing, see the documentation.
生物信息学【1】:cBioPortal数据库 - CSDN博客
2020年9月13日 · cBioPortal(cBio Cancer Genomics Portal综合分析癌症基因和临床资料) • 官方网址: www.cbioportal.org/ • 简介: cBioPortal 网站整合了126个肿瘤基因组研究的数据,包括TCGA和ICGC等大型的肿瘤研究项目,涵盖了两万八千例标本的数据,此外部分样品还包括了临床 …
cBioPortal Software Application - Cancer
The cBioPortal significantly lowers the barriers between complex genomic data and cancer researchers who want rapid, intuitive, and high-quality access to molecular profiles and clinical attributes from large-scale cancer genomics projects and empowers researchers to translate these rich data sets into biologic insights and clinical applications.
cBioPortal for Cancer Genomics by cBioPortal
The cBioPortal for Cancer Genomics provides visualization, analysis, and download of large-scale cancer genomics data sets. The cBioPortal is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms of the GNU Affero General Public License, version 3, as published by the Free Software Foundation.
引用2万次!多维度基因组学综合探索:cBioPortal数据库使用指南
2022年7月24日 · 今天要学习的cBioPortal(http://www.cbioportal.org/)是一个功能更加强大的公共组学资源探索数据库,关于此数据库的首篇文献发表于2012,第二篇发表于2013,两篇文献的引用目前累积超2w,组学数据资源和功能一直在更新之中。 我们可以使用cBioPortal: 1. 对数据库内的所有癌症基因组学数据和临床数据进行访问和下载,支持选择性(自定义筛选)的数据下载; 2. 多维癌症基因组学数据的探索。
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