CRISPR-Cas13系统与crRNA、底物结合形成三元复合体后，Cas13蛋白被激活，此时Cas13蛋白不仅能切割底物RNA，还能切割游离在环境内的任意单链RNA，这个现象被称为旁切活性（collateral cleavage）。 熟知Cas12家族的读者应该并不陌生，因为Cas12家族也具有此类现象，不过Cas12蛋白识别的是双链DNA，并且任意切割的是单链DNA。 基于旁切活性，研究团队开发出各种核酸检测工具。 在这里，本文主要介绍CRISPR大牛张锋开发的SHERLOCK（Specific …

2023年9月18日 · Cas13蛋白都是由多结构域组成的单一蛋白，具有识别crRNA、切割RNA、甚至是切割pre-crRNA的功能。 Cas13蛋白具有2个标志性的 HEPN结构域，2个R-XXXX-H保守基序是HEPN结构域的核酸酶活性位点。 除了Cas13蛋白外，Type VI家族基因位点上还包含 CRISPR array。 CRISPR array由重复序列（Repeat）和间隔序列（spacer）组成，CRISPR array转录形成未成熟的pre-crRNA，经切割形成成熟的crRNA，引导Cas13蛋白发挥功能。 …

2024年5月3日 · Owing to its programmable ability for RNA recognition and cleavage, Cas13 provides powerful RNA targeting, editing, detection and imaging platforms with emerging biotechnological and therapeutic...

2017年10月25日 · Efficient and precise RNA editing to correct disease-relevant transcripts holds great promise for treating genetic disease. Cox et al. took advantage of the ability of Cas13b, an effector from a type VI CRISPR-Cas system, to target specific RNAs directly (see the Perspective by Yang and Chen).

2024年11月11日 · 研究团队使用CRISPR-Cas13靶向编辑RNA，系统性分析了5种人类细胞系（包括肾、白血病和乳腺癌细胞）中近6200个lncRNA。 为了找出必需lncRNA的名单，研究团队利用CRISPR逐个扰乱或敲除这些lncRNA，并观察当每个lncRNA失效后细胞的生存状态。 结果，研究团队确定了778个对细胞功能至关重要的lncRNA，其中46个lncRNA在5种细胞系中均必不可少；其余732个是对一部分细胞系具有特定功能的lncRNA。 图片来源：123RF. 随后，研究团队对 …

为了避免天然胞苷脱氨酶进行RNA编辑的一些固有缺陷，他们升级了腺嘌呤脱氨酶ADAR2DD来脱氨胞苷，并使用dRanCas13b (催化无活性的Cas13)来靶向胞嘧啶脱氨酶。 对与RNA底物接触的ADAR2DD残基进行3轮定向突变，获得了15 %的C - to - U编辑活性。 然后，他们对ADAR2DD进行了16轮定向突变，以进一步优化胞苷脱氨酶活性。 虽然RESCUE可以进行C - to - U编辑，但它保留了腺嘌呤脱氨酶的能力。

2020年3月1日 · CRISPR-Cas13是目前CRISPR-Cas家族中唯一只靶向ssRNA的系统，为RNA靶向和RNA编辑奠定了基础。 根据Cas13系统发育已证明将Ⅵ型CRISPR-Cas系统分为4种亚型（A-D）。 主要对目前最新的靶向RNA技术的CRISPR-Cas13家族的分类以及防御机制进行了综述，介绍了CRISPR-Cas13技术的应用以及基于CRISPR-Cas13家族的RNA编辑系统的最新研究进展。 最后，对目前CRISPR-Cas13 RNA编辑技术体系存在的问题进行了分析和对未来的发展进行展 …

2023年10月24日 · 作为一种功能强大的RNA操作工具，Cas13工具包可实现RNA的特异性敲低、编辑、成像和核酸检测等，其在基因治疗领域也具有巨大的应用潜力。 与靶向DNA的Cas9不同，Cas13核酸酶可以在crRNA的引导下特异性降解靶RNA。 Cas13蛋白还具有独特的反式切割（trans activity）或旁系切割（collateral cleavage）活性，即在crRNA和靶RNA同时存在的情况下，激活的Cas13会非特异性地切割其周围的其它RNA。 这种非特异切割活性往往会干扰Cas13 …

利用CRISPR-Cas13编辑RNA并避免脱靶活性，作者系统分析了5种人类细胞系（包括 肾癌 、 白血病 和 乳腺癌 细胞）中近6200对长链非编码RNA（lncRNA）基因和附近的蛋白编码基因。 他们利用CRISPR扰乱或敲除每个lncRNA，看看会发生什么——细胞是会死亡、停止增殖，还是可以耐受？ 并确定每个lncRNA是否是必需的。 论文共同第一作者、Sanjana实验室博士后Wen-Wei Liang说，“有了Cas13，我们可以具体地询问‘这些转录本的功能是什么？ ’它们不是垃圾，我 …

一种新型核酸酶Cas13a (以前称为C2c2)正开始进入人们的视野,它具有独特的性质,进一步扩展了CRISPR工具箱.我们将介绍一下 Cas13a 的独特性质以及各种应用。 Cas蛋白的分类. 根据Cas蛋白的分类和效应复合物的性质主要分为两大类Class 1和Class 2，六种不同类型。 2类系统包括类型II、V和VI，只有一个具有内切酶活性的多结构蛋白。 II类CRISPR-Cas系统 CRISPR/Cas9系 统已用于基因敲除和敲入以及基因组标记等,方便基因操作和基因组研究。 Cas13a的独特之处. …