We developed and evaluated a powerful signature tool, Coding-Non-Coding Index (CNCI), by profiling adjoining nucleotide triplets to effectively distinguish protein-coding and non-coding sequences independent of known annotations. CNCI is effective for classifying incomplete transcripts and sense-antisense pairs.

CNCI （ Category Normalized Citation Impact ，学科规范化引文影响力）指标则是其中一种较为有效的工具。 一、 CNCI 指标的概念. CNCI 指标的定义如下： 一篇论文的 CNCI 值是通过其实际被引次数除以同文献类型、同出版年、同学科领域文献的期望被引次数获得的。

2019年12月18日 · 为了克服上述问题，研究人员开发出了一款新的工具CNCI, 和CPC不同，该软件基于三联体碱基的构成来区分coding和noncoding转录本，论文发表在Nucleic Acids Research上，网址如下

2021年6月27日 · CNCI (Coding-Non-Coding Index) is a powerful signature tool by profiling adjoining nucleotide triplets to effectively distinguish protein-coding and non-coding sequences independent of known annotations.

2019年1月30日 · CNCI利用三联体碱基构成区分coding和noncoding转录本，通过支持向量机模型实现对脊椎动物的分类。 CNCI在不同长度转录本上的性能表现优秀，源代码在GitHub公开，并提供Python脚本安装和使用。

2020年1月18日 · CNCI是由中科院研发的一款基于SVM（支持向量机）的LncRNA预测软件，它可以不依赖于已知的RNA注释信息来进行预测，同时其对不完全转录和反义的RNA有着良好的分类效果，本文将根据github的说明总结一些简单的操作。 cd .. 1， compare.py: compare the merged/assembled transcripts with known gene annotation! 文章浏览阅读6.3k次。

2020年4月23日 · Five coding potential prediction tools with different intrinsic sequence-related features (composition, structural properties and motifs) and divergent filtering steps (Weikard et al. 2017) including CPC2 (score > 0.5) (Kang et al. 2017), CNCI (score > 0) (Sun et al. 2013b), CPAT (score > 0.36) (Wang et al. 2013), PLEK (score > 0) (Li et al ...

采用编码非编码指数(cnci)、编码电位计算器(cpc)、编码电位评估工具(cpat)和pfam-scan(1.3版，e值<0.01)对具有编码电位的转录本进行剔除。 最终鉴定出6258个高度可靠的LncRNAs

We developed and evaluated a powerful signature tool, Coding-Non-Coding Index (CNCI), by profiling adjoining nucleotide triplets to effectively distinguish protein-coding and non-coding sequences independent of known annotations. CNCI is effective for classifying incomplete transcripts and sense-antisense pairs.

Here, we describe a de novo approach named coding-noncoding index (CNCI), a powerful signature tool by profiling adjoining nucleotide triplets (ANT) to effectively distinguish between protein-coding and noncoding sequences independently of known annotations.