
文献解读|Science重磅:ZNF800抑制肠道干细胞分化为肠内分泌 …
实验结果显示,在znf800/pax4双敲类器官中重新表达pax4可以显著抑制arx的表达,并将eec的分化重定向到ec偏向的轨迹中。 然而,通过ChIP-qPCR实验发现,与ZNF800不同,ARX并不与PAX4上游的增强子区域结合。
Hans Clevers最新成果 | 类器官&CRISPR揭秘人肠内分泌细胞的调控 …
该研究对人肠类器官进行了CRISPR敲除筛选,发现ZNF800是EEC分化的主要抑制因子,它通过调控以PAX4为中心的转录因子网络,特异性地限制肠组织细胞分化。 1.人小肠类器官CRISPR基因敲除文库. 利用慢病毒递送系统,在人肠类器官中构建CRISPR敲除文库。 这个文库包含了靶向1800个人类转录因子的7210个sgRNA,以及100个非靶向的sgRNA作为阴性对照。 通过荧光报告系统(CHGA-IRES-iRFP670:EEC,MUC2-mNeongreen:杯状细胞,DEFA5-IRES …
Unbiased transcription factor CRISPR screen identifies ZNF800
2023年10月26日 · Among its direct downstream targets, INSM1, SOX4, and NEUROG3 are well described central players that drive early EEC commitment. We also found that PAX4, in the absence of ZNF800, drives an EC-specific cell fate by …
“类器官之父”Hans Clevers团队Science发文,揭示类器官+CRISPR …
2023年10月30日 · 通过对pax4的进一步研究发现,znf800可以直接调控pax4来限制肠嗜铬细胞的分化。 此外,PAX4还通过单方面抑制一种EEC亚型TF(ARX),来调控其他EEC亚型 ...
Unbiased transcription factor CRISPR screen identifies ZNF800 as …
2023年10月27日 · We discovered ZNF800 as a master repressor for endocrine lineage commitment, which particularly restricts enterochromaffin cell differentiation by directly controlling an endocrine TF network centered on PAX4. Thus, organoid models allow unbiased functional CRISPR screens for genes that program cell fate.
「Science重磅」类器官+CRISPR,靶向1800个人类TF后有重大发现!
2024年3月8日 · 研究人员重点研究了znf800的三个直接靶基因insm1、sox4和pax4,发现敲除insm1可完全逆转eec诱导,敲除sox4或pax4可减少eec数量。
今日Science:破解人类肠内分泌细胞命运的调控密码 | 热心肠日报
2023年10月27日 · Science最新发表的一项研究,利用人肠道类器官和CRISPR基因敲除筛选系统,对调控成人EEC谱系分化的转录因子进行了大规模无偏鉴定,发现一个此前功能未知的锌指蛋白转录因子ZNF800,在EEC谱系分化中发挥主导作用,处于内分泌转录因子网络的上游位置。 这项工作展示了优化人类类器官在基于CRISPR的功能筛选中的价值潜力,为鉴定人类肠道生理学和病生理学中的其他调节因子铺平了道路。 (@mildbreeze) 【原文信息】 Unbiased …
类器官之父发表Science论文:类器官+CRISPR筛选,发现肠内分泌 …
2023年10月27日 · 研究团队进一步解析了 ZNF800 调控ECC分化的机制,驱动早期ECC分化的核心参与者INSM1、SOX4和NEUROG3是ZNF800的下游直接靶点,ZNF800通过直接调控以PAX4为核心的内分泌转录因子网络,特别限制了肠嗜铬细胞的分化。 在ZNF800缺失的情况下,PAX4通过抑制所有其他EEC亚型的分化来驱动EC特异性细胞命运。 此外,PAX4还通过单方面抑制另一个EEC亚型转录因子 ARX,来调控EEC亚型的分化。 我们发现ZNF800是肠内分泌分化的主要 …
“类器官之父”Science发文:类器官+CRISPR 控制肠内分泌分化的关 …
2023年10月29日 · 研究构建了基于成年人类小肠类器官和crispr基因敲除的高通量筛选平台,对调控人类肠内分泌细胞(eec)谱系分化的转录因子(tf)进行系统性无偏鉴定;发现znf800是在内分泌谱系定向分化中起主导作用的转录抑制因子;znf800直接抑制内分泌tf调控网络(其靶基因 ...
Cell | 单细胞+空间转录组解析人类肠道发育的时空密码 - 知乎
2021年1月5日 · RL映射建立了核心EEC信号通路,如肠嗜chromaffin细胞,常见于结肠12pcw,通过多种途径与抑制性运动神经元相互作用,包括TPH1-HTR2B,一种已知的食欲/运动中的5 -羟色胺信号通路(Figure S3Cii)。