2022年5月6日 · 本文中，使用FSL-bet工具提取脑组织 要使用 FSL 执行大脑提取，您可以使用图形界面，也可以使用命令行（MacOS 或 Ubuntu Linux 上的终端应用程序）。 本操作指南假定您已安装 FSL。

By default bet just calls the bet2 program for simple brain extraction. However, it also allows various additional behaviour. The basic usage is: bet <input> <output> [options] -o generate brain surface outline overlaid onto original image. -m generate binary brain mask. -s generate rough skull image (not as clean as what betsurf generates)

2023年8月30日 · 作为AI助手，我可以告诉你如何使用fsl bet批量处理。 fsl bet 是一种用于脑部MRI图像去除头骨和非脑组织的工具。 批量 处理可以帮助我们快速处理多个MRI图像。

FSL有一个名为 bet 的工具，即大脑提取工具。 它是FSL图形用户界面上列出的第一个按钮（BET brain extraction,在下图中用 “A “表示）。 如果你点击这个按钮，就会打开另一个窗口，允许你指定输入图像来进行头骨剥离，以及对已进行头骨剥离的输出图像进行标注（B），还有一个可扩展的子窗口，允许你指定高级选项（C）。 对于BET和许多其他FSL工具，你需要指定一个输入图像和一个输出图像的标签： 在输入图像上进行一些操作（例如头骨剥离），输出图像是该操作的 …

Most FSL programs can be run from the command-line without using a GUI, by typing fully lowercase names (e.g. bet). Many programs also have a GUI, which can be started via the fsl mini-GUI (type fsl ) or by typing a capitalised version of the command name (e.g. Bet ).

Since fMRI studies focus on brain tissue, our first step is to remove the skull and non-brain areas from the image. FSL has a tool for this called bet, or the Brain Extraction Tool. It is the first button listed on the FSL GUI (indicated by “A” in the figure below).

HD-BET outperformed five publicly available brain extraction algorithms (FSL BET, AFNI 3DSkullStrip, Brainsuite BSE, ROBEX and BEaST) across all datasets and yielded median improvements of +1.33 to +2.63 points for the DICE coefficient and -0.80 to -2.75 mm for the Hausdorff distance (Bonferroni-adjusted p<0.001).

Run the BET tool: from the GUI (simply fill in the input image; default output image is created, but can be changed) from the command line (specify input and output image names) Check outputs: load brain extracted image over original image in FSLView (use …

2018年3月20日 · 在linux系统下anaconda环境通过Nipype包使用FSL软件的BET()算法，去掉MRA中的颅骨，提取纯净的脑组织区域。 注意：Nipype只是平台，要使用 BET 算法还需要安装 FSL 软件。

BET (Brain Extraction Tool) deletes non-brain tissue from an image of the whole head. It can also estimate the inner and outer skull surfaces, and outer scalp surface, if you have good quality T1 and T2 input images. If you use BET, please make sure that you quote the following reference in any publications: S.M. Smith.