
肿瘤耐药研究神器之——GDSC – 王进的个人网站
2021年7月23日 · 我们在做肿瘤耐药研究的时候,经常会从一种药出发研究肿瘤耐药的机制,而GDSC就收录了常用的265种肿瘤药物的IC50、靶点、信号通路等信息,我们看一下: 在主页的三个主题Compound、Cancer Feature和Cell line中,我们点击Compound: 结果出来所有药物的列 …
生信数据库4: GDSC(癌症药物敏感性基因组学 ... - 简书
2023年12月15日 · GDSC(Genomics of Drug Sensitivity in Cancer)数据库由英国桑格研究院开发,收集肿瘤细胞对药物的敏感度和反应。 是目前肿瘤细胞药物敏感性的最大公共资源,收录1000多种癌细胞系中的621个抗癌化合物的作用广泛,涉及24种通路。
如何使用GDSC数据分析基因的药物敏感性 - 51CTO博客
2024年10月10日 · GDSC(Genomics of Drug Sensitivity in Cancer)是一个大型数据库,提供了多种癌症细胞系对不同药物的敏感性数据以及对应的基因组信息。 本文将详细介绍如何利用GDSC数据库,分析基因的药物敏感性,包括数据获取、数据处理、分析步骤以及代码示例。
肿瘤药敏多组学数据库(GDSC)的数据介绍和获取 - 腾讯云
2020年7月6日 · gdsc储存了细胞系基因组学数据: 包括全外显子测序、转录组测序、芯片测序(人类肿瘤细胞系1000)、拷贝数变异、dna甲基化、融合数据等原始及部分处理过的数据。点击对应的链接,将会跳转至数据贮存的页面。
GDSC、CTRP数据库学习 - CSDN博客
2024年11月13日 · GDSC官网:http://www.cancerrxgene.org/ 由于在官网下载数据过于麻烦,于是我使用了另外的下载途径https://osf.io/c6tfx/(该网址为oncoPredict包的作者所收集处理的), …
药敏性分析数据库知多少? 生信分析强助攻,一篇推文帮你搞定6大 …
药物敏感性基因组学项目 (GDSC)是关于癌症细胞药物敏感性和药物反应分子标记的数据库,GDSC提供了一个独特的资源,结合了药物敏感性和基因组数据集,以促进发现新的治疗生物标志物的癌症治疗。 该数据库中的癌基因组突变信息包括癌基因点突变、基因扩增与丢失、组织类型以及表达谱等,数据库已经对1000 种人类癌细胞系进行了表征,并用100 多种化合物对其进行了筛选。 GDSC是个开源、免费的在线数据库。 网址为 cancerrxgene.org/ 3. Cell Miner数据库( …
抗癌药物敏感性数据库——GDSC - 简书
2020年7月16日 · 抗癌药物敏感性基因组学(https://www.cancerrxgene.org/),即Genomicsof Drug Sensitivity in Cancer (GDSC),是目前关于癌症细胞药物敏感性和分子标志物信息的最大的公共数据库。该数据库基于多个研究与数据库信息,整合并重新分析,从细胞、药物和分子三个检索 …
生信数据库12-药物敏感性基因组学项目(GDSC) - 简书
2022年7月4日 · 癌症相关药物敏感性基因组学(GDSC,Genomics of Drug Sensitivity in Cancer)桑格研究院开发,收集肿瘤细胞对药物的敏感度和反应。 癌基因组的变异会影响临床治疗的效果,不同的靶点对药物的反应也有很大不同,因此这类数据对于发现潜在的肿瘤治疗靶点十 …
探索GDSC数据库:解密肿瘤细胞株基因组信息 (gdsc数据库)
2023年7月23日 · GDSC(Genomics of Drug Sensitivity in Cancer)数据库是一个主要汇集了肿瘤细胞株对于各种抗肿瘤药物的敏感性数据以及基因组学数据的数据库。 GDSC数据库的创建旨在为科研人员和医药企业提供一个科学、准确且开放的平台,以便分析和评估肿瘤细胞株对于药物的敏感性,从而促进肿瘤治疗新方法和新药物的开发。 GDSC数据库的数据内容包括:肿瘤细胞株的基因组信息、细胞株的特征、药物敏感性等。 该数据库包含超过1000个肿瘤细胞株和400种抗肿 …
癌症药物敏感性基因组学数据库:GDSC - 51CTO博客
2021年3月28日 · GDSC数据的分析是通过一个门户网站,侧重基于特定抗癌药物或癌症基因的查询来鉴定药物敏感性的分子生物学标记。 数据的图形表示贯穿于相关资源的链接,所有数据集都是完全可下载的。 GDSC提供了一个独一无二的资源,其中包含大量药物敏感性和基因组数据集,以促进癌症治疗新的治疗生物标志物的发现。 数据库首页截图. 1、细胞系药物敏感性数据 Cell line drug sensitivity data. 癌症细胞系药物敏感性数据是由Wellcome Trust Sanger研究所(WTSI) …
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